计算化学公社

标题: 欢迎参加第11届北京科音分子动力学与GROMACS培训班（8月13日~16日，北京） [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-24 01:18
标题: 欢迎参加第11届北京科音分子动力学与GROMACS培训班（8月13日~16日，北京）
2022-Jul-27更新：以下为预告内容。报名已经开始，请访问http://www.keinsci.com/workshop/11KGMX查看

北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）将于2022年8月13日~16日于北京举办第11届北京科音分子动力学与GROMACS培训班。此帖为预告贴，培训正式报名将于2022年7月27日中午12:00在北京科音官网的http://www.keinsci.com/workshop/11KGMX页面正式开始，欢迎参加并相互转告！欲系统性学习分子力学与GROMACS程序者切勿错过这个难得的机会！

与培训有关的信息，如报名流程、发票、住宿、讲义、有没有线上培训、邀请函等问题，见《北京科音办的培训班FAQ》（http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html）。如果仔细看了FAQ对于培训仍有不清楚的问题，请发电子邮件到北京科音官方邮箱keinsci[at]sina.com咨询。本培训更多细节信息可参考上一届（第10届）的培训的正式通知：http://www.keinsci.com/workshop/10KGMX。

培训简介

分子动力学模拟如今在化学领域有着极其广泛的应用，相关研究文章和研究者数目迅猛增长。GROMACS是目前流行程度最高、速度极快、适用性非常广而且开源免费的十分强大的分子动力学程序。本培训将会用简单易懂的语言和非常丰富的实例，以最好、最快、最正确的方式带领初学者（包括零基础的）顺利踏入分子动力学模拟的大门，在充分了解分子动力学基础知识的同时能够通过强大的GROMACS程序顺利、合理地完成各种常见体系的分子动力学模拟任务，并学会如何对结果进行分析处理来获得对研究工作有用的数据。本培训的深度绝非仅限初级班的程度，而是同时面向入门和提高。本培训涉及的模拟体系相当广泛，对模拟技术和GROMACS程序各方面有非常系统和深入的讲解，并穿插介绍大量经验技巧，因此也很适合已具备一定分子动力学知识和GROMACS使用经验的研究者进一步全面提升水平、查缺补漏。之前有做动力学模拟已达10年的经验丰富的学员都表示从本培训中新学到了很多东西。

本培训对于分子动力学和GROMACS初学者更是绝对不容错过的。这部分研究涉及的知识相当广泛和琐碎，而且涉及的操作、命令、细节极多，新人光是自己啃讲授基本理论的书籍和照着网上缺乏系统性的零七八碎的（很多还是严重误人子弟的）资料鼓捣，极难正确摸索出门道，距离能算出有意义的数据并发表文章遥遥无期，还总是会由于犯低级错误导致白白浪费巨量时间和计算资源、投文章后被审稿人告知模拟方法存在严重不合理性而被拒或者需要重算。而本培训则可以为初学者上手分子动力学计算扫清各种可能涉及到的障碍，彻底理清头绪，一次性搞懂如何正确地建模、计算和恰当地分析结果。本培训内容详实程度就像宝典，即便在初学者已经入门后，时常反复复习加深印象，水平还可以再进一步提升。即便是由于特殊原因需要使用AMBER、NAMD、LAMMPS等其它动力学程序的初学者，本培训对他们也极有好处，因为用不同动力学程序做模拟所需要的知识很大程度上都是共通的，一旦通过参加本培训玩转了GROMACS和VMD并同时具备了足够的分子模拟的理论知识，自己看相关手册和教程上手其它动力学模拟程序也就没有多少难度了。

本系列培训的高水准、高含金量得到历届参加者的非常高的评价！非常欢迎浏览历届培训回顾和学员参加后的感想：http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=forumdisplay&fid=43&filter=typeid&typeid=248。

欲报名本次培训的学员务必把握这次难得的上手量子化学计算的宝贵机会，建议根据《北京科音办的培训班FAQ》（http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html）里事先准备好要填入报名表里的信息，在报名开始后尽快填写并发送报名表，以免遗憾地报不上。

培训内容

本培训的详细介绍和讲授内容详见 http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html，相对于上一届又有一定更新和补充，特别是加入了讲授者开发的创建GROMACS拓扑文件的灵活强大的sobtop工具（http://sobereva.com/soft/Sobtop）的介绍。

我们精心制作的培训用的幻灯片多达1500多页，相关文件多达1800多个。由于课程内容过于丰富，现场的4天无法全部讲完，因此还另提供约10个小时的补充视频讲课上来不及讲的主题。培训还有专属的QQ群，培训结束后两周内如果对培训所讲的内容有任何疑问、没完全搞懂的地方都可以在群里提问。即便在群解散后，讲授者依然会永久地、无偿地在总共9000人的国内规模最大、最活跃的计算化学QQ群“思想家公社”（18616395、466017436、764390338）和最专业、人气最高的计算化学论坛“计算化学公社”（http://bbs.keinsci.com）中对学员学习和科研过程中遇到的问题进行解答。

讲授者介绍

本次培训由卢天讲授。卢天任北京科音自然科学研究中心主任，是规模最大的9000人的计算化学综合交流群“思想家公社”QQ群（18616395、466017436、764390338）的群主、知名的计算化学公社论坛（http://bbs.keinsci.com）的创立者和维护者，有超过15年GROMACS使用经验，并常年在网上热心解答巨量计算化学问题，包括大量的分子动力学与GROMACS相关问题。卢天在分子动力学模拟方面有丰富的经验和深入的研究，发表文章80余篇，被引用19000多次，连续入选Elsevier中国高被引学者名单，入选全球学者库网站公布的全球排名前10000的中国学者名单，担任60多种国际性期刊的审稿人。个人详细介绍见http://www.keinsci.com/members/Tian_Lu.shtml。

培训费用

本培训现场授课共四天，共计4*8=32小时。由于内容实在太丰富，在课堂上有限的时间内无法全部讲完，故另提供10个小时的额外补充视频，因此等同于4+1天。费用如下：
学生自费价：1650元
教师（含博士后）以及企业人员自费价：1950元
学生公费价：2450元
教师（含博士后）公费价：2700元
企业人员公费价：3000元

注：北京是COVID-19疫情低风险地区，本培训只允许低风险区域的学员到现场参加，并要求所有学员全程佩戴口罩，参加者完全无需担心感染COVID-19疫情的风险。在疫情防控期间，北京科音像往常一样非常成功地举办了一系列计算化学培训，各个培训的回顾见http://bbs.keinsci.com/forum-43-1.html。疫情完全没有对培训造成妨碍，我们对培训的精心安排也完全杜绝了交叉感染的隐患。

报名前请务必向学校有关负责人咨询学校的具体管理政策，确定会议期间可以离校参会，如果报名并完成付款后才告知我们无法现场参加会议，则只可退回报名费的2/3，或者选择由主办方邮寄培训资料和发送相关的电子资料，结合培训的全程录音+群内答疑进行学习。

关于无法到现场参加的情况：由于疫情管控以及时间安排等原因，有的师生不便到现场参加本培训。对于这类情况，可以照常报名并付款（和到现场听课的费用相同），然后由我们在培训前夕快递寄送印有全部培训所用幻灯片的极高含金量的讲义，通过提供的链接下载课上用到的所有电子资料，在培训全四天完全结束后还可以在培训班的专用网盘里下载现场的全程培训录音。由此通过讲义+录音+电子资料的方式自学也可以达到不错的学习效果。如果有任何搞不懂的都可以在培训群里问，会及时得到详细的解答。此类学员请在发送报名邮件的时候需注明是不到现场的，我们没有名额限制（注意这不叫线上培训，切勿向我们发邮件问是否有线上培训，本培训绝对不会有线上形式，既没有现场视频也没有现场直播，原因在《北京科音办的培训班FAQ》http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html里红字写明了）。

作者
Author: qingqingqing 时间: 2022-7-24 02:02
请问本次培训会讲解Sobtop的使用吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-24 02:11

qingqingqing 发表于 2022-7-24 02:02
请问本次培训会讲解Sobtop的使用吗？

写了

特别是加入了讲授者开发的创建GROMACS拓扑文件的灵活强大的sobtop工具（http://sobereva.com/soft/Sobtop）的介绍。

作者
Author: yang2020 时间: 2022-7-24 17:50
期待

作者
Author: zzffzz33 时间: 2022-7-26 10:10
期待

作者
Author: 1015866003 时间: 2022-7-27 20:04
sob老师，您好。我上午报名时，在报名表中忘了填写“是/否”开发票，可能因为这个导致没有即使审核，而现在报名人数已满，我也没有报上，但是与我同门的师兄报上了，所以现在很麻烦。因为GROMACS需要我们两个共同学习，所以现在一个人参加培训，一个人不参加培训会对后续科研工作造成很大麻烦，渴望老师能给我这个机会去认真学习GROMACS，相信我定会不虚此行，如果sob老师能给我这个机会，我将不胜感激。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-28 06:05

1015866003 发表于 2022-7-27 20:04
sob老师，您好。我上午报名时，在报名表中忘了填写“是/否”开发票，可能因为这个导致没有即使审核，而现在 ...

请发邮件到北京科音官方邮箱说明情况

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)