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标题: 用gromacs做完分子模拟,然后做脂膜deuterium order parameters分析,结果好坏如何看 [打印本页]

作者
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free3hao    时间: 2022-7-25 10:14
标题: 用gromacs做完分子模拟,然后做脂膜deuterium order parameters分析,结果好坏如何看
各位大佬,我用genmixmem构建出混合脂膜,然后做了分子模拟,之后又对其中一种脂质的sn1和sn2做了deuterium order parameters分析,结果如下图,“KALP15 in DPPC“的分析如第二幅图,感觉我自己做的波动很大,请问结果可信吗? (, 下载次数 Times of downloads: 14) (, 下载次数 Times of downloads: 16)

作者
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CruiseBend    时间: 2022-7-26 13:54
注意Scd的定义,如果定义seta角是CH和z轴的夹角的话,正常的Scd应该也就是0-0.4之间,你这种图形很有可能是lipid还没有平衡,或者是平衡了取了没平衡段算的




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