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标题: 求助：蛋白和小分子动力学模拟NVT平衡时初始温度非常高是什么情况呢？ [打印本页]

作者
Author: jimking 时间: 2022-7-25 20:58
标题: 求助：蛋白和小分子动力学模拟NVT平衡时初始温度非常高是什么情况呢？
各位老师，我跑NVT时初始温度很高，达到了600多，这种情况该怎么解决呢？
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nvt.mdp如图所示
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麻烦各位老师指导。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-26 03:08
一开始体系内部往往有不合理接触，斥力很大，导致模拟初期可能有很多原子运动很快，对应温度较高。只要后续没问题就没关系

作者
Author: jimking 时间: 2022-7-27 22:24

sobereva 发表于 2022-7-26 03:08
一开始体系内部往往有不合理接触，斥力很大，导致模拟初期可能有很多原子运动很快，对应温度较高。只要后续 ...

明白了，谢谢sob老师

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