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标题: 分子动力学模拟-如何证明材料一维生长 [打印本页]

作者
Author: Grease 时间: 2022-7-27 09:53
标题: 分子动力学模拟-如何证明材料一维生长
老师们好！我通过分子动力学模拟了有机小分子盐在有机溶剂内的聚集过程，理论上有机小分子盐会进行一维生长，生成纤维状。但是通过观察分子动力学模拟后的快照，一维生长的特点不是很明显。我想请问一下，有没有合适的统计方法或者什么方法能定量的描述出有机小分子盐的一维生长特性。谢谢解答！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-27 17:08
先确保你模拟的时间长度足够长
晶体生长从微观尺度来说往往是很慢的过程。由于M$动力学模块速度极慢，很多用M$的人跑的时间尺度都明显太短（尤其是相对于用速度快一两个数量级的GROMACS用户而言）

作者
Author: EdwardLimit 时间: 2022-7-27 19:53
MS里面带的MD模块所能研究的时间尺度和空间尺度都挺拉跨的，你先确定一下你所研究问题的特征时间和特征尺度，在看选啥软件，和选啥力场。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-27 20:31
首先确认实验上纤维有多宽。如果比如说纤维有100nm宽，但是你的周期性盒子只有10nm宽，那肯定算不出纤维。

作者
Author: 对抗路达摩 时间: 2022-7-27 21:00
我的师兄模拟一个两步成核的体系，是先形成聚集体，再重拍成fiber。聚集体通常100个ns内就形成了，而fiber根据温度和体系大小，形成的时间需要3000ns-15μs不等

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