计算化学公社

标题: 求助：固态有机分子掺杂体系中体系怎么建立较合理？再用高斯优化后的结构为啥呈弧形？ [打印本页]

作者
Author: 王光明 时间: 2022-7-27 10:48
标题: 求助：固态有机分子掺杂体系中体系怎么建立较合理？再用高斯优化后的结构为啥呈弧形？
本帖最后由王光明于 2022-7-27 21:24 编辑

各位老师好，我想构建A:B=1:100的固态有机分子掺杂体系，要求是将A放在中心。
目前我看到的两种方法分别是：
1.用packmol将A和B分子放在盒子里，并将A固定在中心。但是我用这个建立的体系，在高斯中用 ONIOM model，将A设为高层，选择# opt oniom(M062X/DEF2svp:UFF) geom=connectivity进行结构优化。问题是优化后的联苯结构，两个苯环平面呈现弧状，看着有些不合理，结果见图1。是存在什么问题呢？这种优化方式合理吗
2.我看文献有通过在B的supercell中心的两个B分子用A来替换，如图2，我想请教一下，这种替换怎么能实现呢？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)