计算化学公社
标题:
求助:关于mpirun中-np的设置
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作者Author:
shinkon
时间:
2022-7-27 12:43
标题:
求助:关于mpirun中-np的设置
各位老师同学好,问题是这样的,我打算在超算上并行运算一个vasp任务(该超算一个计算节点32核),但一个节点用满32任务的话算完一个离子步会爆内存(800原子的AIMD)
按组里师兄的意见是打算降低每个节点的任务数量。
该超算使用的slurm调度系统,如果我设置ntasks per node那一项(小于32),则会和其他用户共享某个计算节点。但我不太了解如何设置mpirun的-np选项。比如我打算在4个节点上运行该计算,每个节点使用8个任务,那么-np是8还是32呢?
谢谢!
作者Author:
abin
时间:
2022-7-27 13:00
如果你的集群有使用手册的话,
仔细看看手册.
如果么有手册的话,
看看这个,
https://gitee.com/hpc4you/hpc
PDF文档, hpc4you-toolkit-manual-pub-v2.pdf
最后部分, slurm技能自我修养部分.
作者Author:
zmjsce
时间:
2022-9-2 00:10
可以看一下slurm手册中关于--exclusive关键词的解释,可能能解决第一个问题。
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