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标题: ADMP模拟质子取代反应 [打印本页]

作者
Author: halouhapily 时间: 2022-7-28 10:20
标题: ADMP模拟质子取代反应
各位老师好，
我想要通过ADMP模拟质子取代反应过程，
反应物为香豆素衍生物和硝酸铕六水合物，实验上通过傅里叶红外光谱和核磁谱都显示羧酸上的质子被取代了，
但是我进行动力学模拟时，两个反应物结合后并没有使质子解离，这是什么原因呢？

作者
Author: chands 时间: 2022-7-28 14:33
本帖最后由 chands 于 2022-7-28 14:35 编辑

不熟悉你的体系，但是觉得实际微观过程比你的ADMP模拟要复杂。我猜最后得到去质子的香豆素衍生物作为配体配到Eu上？这个配合物的结构你知道吗？感觉不止三个配体分子。可能部分溶剂（乙醇）分子要显式表示出来，还有质子的受体是什么？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-28 14:38
可能质子转移相对比较慢。实验上两者混合以后，你肯定是至少过了几秒才测的红外和核磁，但是ADMP一般只能跑ps级的时间。万一这个反应需要ns到秒级的时间，就会出现ADMP看不到反应、但实验上能看到反应的情况。
事实上，认为”实验上看到的反应，AIMD（包括ADMP、BOMD）必然也能看到“是一个常见的误区，参见https://mattermodeling.stackexch ... t-or-aimd/9026#9026

作者
Author: halouhapily 时间: 2022-7-30 20:40

chands 发表于 2022-7-28 14:33
不熟悉你的体系，但是觉得实际微观过程比你的ADMP模拟要复杂。我猜最后得到去质子的香豆素衍生物作为配体配 ...

老师，实验中反应是在50摄氏度下进行的，溶剂为乙醇溶液，
最后的结构中Eu离子的配体有两个香豆素配体和一个硝酸配体，还有一个水分子
质子的受体这个不是很清楚欸，

作者
Author: halouhapily 时间: 2022-7-30 20:41

wzkchem5 发表于 2022-7-28 14:38
可能质子转移相对比较慢。实验上两者混合以后，你肯定是至少过了几秒才测的红外和核磁，但是ADMP一般只能跑 ...

嗯呢，我明白了，谢谢老师

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