计算化学公社

标题: 请问在Gview中如何让分子以某一原子为中心旋转? [打印本页]

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UTM    时间: 2022-8-1 15:56
标题: 请问在Gview中如何让分子以某一原子为中心旋转?
请问各位老师同学,我想让分子围绕其中的一个原子进行旋转,即固定其中一个原子的坐标,旋转分子。请问可以吗?

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乐平    时间: 2022-8-1 16:32
本帖最后由 乐平 于 2022-8-1 16:34 编辑

在旋转中心(也就是你说的那个原子)上添加垂直于它的虚原子,然后调整二面角就行了(注意,让连着分子那一端设置为 Rotate groups ,让虚原子那一端固定 Fixed)

(, 下载次数 Times of downloads: 3)

p.s. 本来想上传 GIF 动图的(1.6 MB),结果说文件太大上传不了…… 但是明明文件不大啊…… 奇怪



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UTM    时间: 2022-8-1 16:38
乐平 发表于 2022-8-1 16:32
在旋转中心(也就是你说的那个原子)上添加垂直于它的虚原子,然后调整二面角就行了(注意,让连着分子那一 ...

请问该如何添加虚原子?
作者
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乐平    时间: 2022-8-1 16:42
UTM 发表于 2022-8-1 16:38
请问该如何添加虚原子?

就跟你添加任何原子一样啊
(, 下载次数 Times of downloads: 15)

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朽木可自雕    时间: 2022-8-1 16:47
我觉得这是个伪命题,不存在 "围绕其中的一个原子进行旋转" ,  旋转必定有轴。只有一个点的话,对称操作只有反演
作者
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乐平    时间: 2022-8-1 16:51
朽木可自雕 发表于 2022-8-1 16:47
我觉得这是个伪命题,不存在 "围绕其中的一个原子进行旋转" ,  旋转必定有轴。只有一个点的话,对称操作只 ...

所以要添加虚原子形成旋转轴嘛
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sobereva    时间: 2022-8-1 22:38
乐平 发表于 2022-8-1 16:32
在旋转中心(也就是你说的那个原子)上添加垂直于它的虚原子,然后调整二面角就行了(注意,让连着分子那一 ...

论坛对于图片文件尺寸有限制,而且动图可能自动加水印后就动不了了。可以压缩成rar之后传
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UTM    时间: 2022-8-1 23:54
乐平 发表于 2022-8-1 16:42
就跟你添加任何原子一样啊

ok,明白了,谢谢!
作者
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UTM    时间: 2022-8-1 23:56
朽木可自雕 发表于 2022-8-1 16:47
我觉得这是个伪命题,不存在 "围绕其中的一个原子进行旋转" ,  旋转必定有轴。只有一个点的话,对称操作只 ...

确实,是我表示有点歧义了
作者
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乐平    时间: 2022-8-2 10:15
sobereva 发表于 2022-8-1 22:38
论坛对于图片文件尺寸有限制,而且动图可能自动加水印后就动不了了。可以压缩成rar之后传

了解,谢谢Sob 老师提示




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