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标题: 求助：文献中关键氨基酸残基贡献度是怎么计算的 [打印本页]

作者
Author: angelhunte 时间: 2022-8-8 14:03
标题: 求助：文献中关键氨基酸残基贡献度是怎么计算的
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动力学优化结果显示，布加替尼与ＲOS1 蛋白中 Lys1980 以及Met2019 氨基酸残基具有较强的氢键结合作用，此外还与Ala1918 和Leu2086 形成稳定的疏水作用( 见图 2B) 。布加替尼与ＲOS1 的相互作用模式( 见图2C、D) ，表明布加替尼可通过上述作用力较好地结合与ＲOS1 蛋白口袋中，发挥对ＲOS1 蛋白的抑制作用。

氢键结合作用、疏水作用是怎么分析出来的？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-10 07:40
什么叫形成了疏水作用，没有唯一的、有共识的判据。仔细看文章里的说明，没写清楚的话就发邮件问作者
至于氢键的存在性，通常用几何标准判断，gmx hbonds就可以分析

作者
Author: angelhunte 时间: 2022-8-10 10:55

sobereva 发表于 2022-8-10 07:40
什么叫形成了疏水作用，没有唯一的、有共识的判据。仔细看文章里的说明，没写清楚的话就发邮件问作者
至于 ...

谢谢老师的耐心回复

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