计算化学公社

标题: 求助,涉及到氢转移,是否要用隐式溶剂模型优化 [打印本页]

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XUETU    时间: 2022-8-9 10:35
标题: 求助,涉及到氢转移,是否要用隐式溶剂模型优化
在合成离子液体时,阴离子甲酸上的氢会成为活泼氢,使得阴阳离子之间形成氢键,这种情况在高斯优化时,需要用隐式溶剂模型优化吗?
之前对离子液体结构优化时,用的B3LYP/6-311G** em=gd3bj。算能量时加上了一个弥散函数,且用的是M06-2X-D3。这种情况下是否可以不选用隐式溶剂模型呢?求老师指点

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chands    时间: 2022-8-9 12:10
需要溶剂模型,甚至需要显式-隐式溶剂模型,即将反应区域附件的溶剂分子显式表示出来。
体系涉及氢键,优化建议加弥散,如果算不动,至少对质子的受体部分加弥散。
可以不加隐式溶剂模型算单点能,不过要加上用溶剂模型计算得到的溶剂化自由能。
作者
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XUETU    时间: 2022-8-9 14:45
chands 发表于 2022-8-9 12:10
需要溶剂模型,甚至需要显式-隐式溶剂模型,即将反应区域附件的溶剂分子显式表示出来。
体系涉及氢键,优 ...

好的好的,十分感谢您的建议
作者
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XUETU    时间: 2022-8-9 21:03
chands 发表于 2022-8-9 12:10
需要溶剂模型,甚至需要显式-隐式溶剂模型,即将反应区域附件的溶剂分子显式表示出来。
体系涉及氢键,优 ...

麻烦再问一下,因为我的是质子型离子液体,质子转移时是在无水条件下进行的,也就是说整个体系是一个纯离子液体体系,这种情况是否也要用溶剂模型?
作者
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chands    时间: 2022-8-9 21:15
XUETU 发表于 2022-8-9 21:03
麻烦再问一下,因为我的是质子型离子液体,质子转移时是在无水条件下进行的,也就是说整个体系是一个纯离 ...

要用,因为不是在真空中的反应。
通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法 http://sobereva.com/431
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XUETU    时间: 2022-8-9 21:33
chands 发表于 2022-8-9 21:15
要用,因为不是在真空中的反应。
通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法 http://sobereva.com/431

好的,谢谢您




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