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标题: 求助关于A+B-->C反应寻找过渡态结构的问题 [打印本页]

作者
Author: xuexi123. 时间: 2022-8-9 17:30
标题: 求助关于A+B-->C反应寻找过渡态结构的问题
大家好，最近在寻找反应的过渡态过程遇到了一些问题。
我的反应是A+B-->C
1、首先利用opt=TS,同时做频率分析寻找过渡态，给了一个合适的初猜结构A，查看最后结果发现得到的结构，得到有且仅有一个虚频，但是虚频振动的反向并不是我想要的结果。2、我对上述的初猜结构A只进行频率分析，查看结果发现有且仅有一个虚频，并且振动方向是我想要的方向，于是在此基础上进行一个IRC验证，走了200步（左右各一百），通过iRC发现，过渡态的位置并不平滑，特别尖，而且左右两边的趋势都是一样的，都是趋于产物的一个过程。
所以我不太明白，1、为什么只做频率分析却可以得到我想要的结果？结合opt+Fre结果却得不到我想要的振动方向？
2、只看频率分析得到的结果可以作为的过渡态吗？
压缩包有我做的文件，希望各位老师能够指点一二。

之前文件放错了，问题也描述错了。。。已修改

作者
Author: kurohimx 时间: 2022-8-9 17:56
本帖最后由 kurohimx 于 2022-8-9 18:03 编辑

opt freq是找极小值点当然是稳定的产物结构，opt=ts才是找鞍点。先在论坛学学基础知识吧，你这做的完全是错的，没有意义。
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)

作者
Author: xuexi123. 时间: 2022-8-9 18:10

kurohimx 发表于 2022-8-9 17:56
opt freq是找极小值点当然是稳定的产物结构，opt=ts才是找鞍点。先在论坛学学基础知识吧，你这做的完全是错 ...

我是用opt=ts 同时进行频率分析找的过渡态呢

作者
Author: kurohimx 时间: 2022-8-9 18:28

xuexi123. 发表于 2022-8-9 18:10
我是用opt=ts 同时进行频率分析找的过渡态呢

那你为什么要对找到的过渡态结构做opt freq？
opt=ts就是优化完的鞍点结构，你对鞍点结构做极小值点的几何优化显然是错的。

作者
Author: xuexi123. 时间: 2022-8-9 18:36

kurohimx 发表于 2022-8-9 18:28
那你为什么要对找到的过渡态结构做opt freq？
opt=ts就是优化完的鞍点结构，你对鞍点结构做极小值点的几 ...

可能是我没表达清楚，我的意思是我利用opt=TS,同时进行Fre，优化出来的结果是上述情况，并没有对找到的过渡态结构再次进行opt+Fre

作者
Author: kurohimx 时间: 2022-8-9 18:46

xuexi123. 发表于 2022-8-9 18:36
可能是我没表达清楚，我的意思是我利用opt=TS,同时进行Fre，优化出来的结果是上述情况，并没有对找到的过 ...

你的给的输入文件opt+freqTS.gjf里的关键词是# opt=noeigen freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity，这是在做什么

作者
Author: xuexi123. 时间: 2022-8-9 20:42

kurohimx 发表于 2022-8-9 18:46
你的给的输入文件opt+freqTS.gjf里的关键词是# opt=noeigen freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity，这 ...

抱歉之前文件放错了问题也描述错了。

作者
Author: 啊嘞嘞 时间: 2022-11-28 09:25
你好，遇到与你相同的问题了，想请教一下你怎么解决的。只看频率分析得到的结果可以作为过渡态吗？如果不可以，这个怎么较好地寻找。

作者
Author: scau·zh 时间: 2023-4-11 11:36
我个人建议：
1、先把反应物都opt freq优化以后
2、对优化后的反应物做预测
3、做柔性面扫描，确定能量最低的点 opt=modredundant
4、做TS分析,虚频唯一负数
5、做irc分析，如果不收敛，加LQA。
我自己是这么做的，希望对你又帮助

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