计算化学公社

标题: 请问高斯计算出的作用能为正数是什么原因 [打印本页]

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suosuosky    时间: 2022-8-14 18:04
标题: 请问高斯计算出的作用能为正数是什么原因
本帖最后由 suosuosky 于 2022-8-14 18:09 编辑

在计算Mg2+与弱质子(A1)和强质子(A2)的卟啉化合物的配位化合物时,都可以优化出稳定构型,但是为什么前者计算出的作用能是负数,但是后者是正数呢?

计算过程:

1-先优化A1, A2, Mg2+, A1-Mg2+,A2-Mg2+的构型,均可稳定存在(B3LYP-D3/6-31g*)。

2-然后根据计算出的能量计算作用能:

A1与Mg2+的作用能为:  E=E(A1-Mg2+)-E(A1)-E(Mg2+)   结果为 -275 kcal/mol  (负数)

A2与Mg2+的作用能为:  E=E(A2-Mg2+)-E(A2)-E(Mg2+)   结果为 95 kcal/mol (正数)

不管采用零点校正的能量还是吉布斯自由能算出来都是上面的趋势。但是实验上推测A2与Mg2+的吸附能更大才对,但是目前的计算结果不知道怎么解释。

计算文件在附件,请问A2与Mg2+的作用能为正数的原因什么呢?

请大家指教,谢谢大家!






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niobium    时间: 2022-8-14 18:33
本帖最后由 niobium 于 2022-8-14 18:35 编辑

你第2个结构多了两个氢,我感觉Mg离子进去(或者出来),需要能垒,感觉不能简单地用结合能来说明问题了。或者可以理解为复合物2是在复合物1的基础上再结合两个氢离子得到的。


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suosuosky    时间: 2022-8-14 18:50
niobium 发表于 2022-8-14 18:33
你第2个结构多了两个氢,我感觉Mg离子进去(或者出来),需要能垒,感觉不能简单地用结合能来说明问题了。 ...

谢谢您的回复。

因为强质子环境中存在A2分子是可以优化出来的,为什么不能理解为A2与Mg2+的配位作用呢?如果是单单理解为求配位键的强度不可以吗?为什么会出现正呢,还是不太明白呢
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hxd_yi    时间: 2022-8-14 21:10
实验是在溶剂中做的吧?加上溶剂化效应再算一下。
但是我觉得即使加上溶剂化效应,A1、A2的结合能差距会缩小,但是不会改变符号。两个正二价的离子结合成一个正四价的化合物,结合能为正太正常了。你确定电荷没问题?
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suosuosky    时间: 2022-8-15 06:21
hxd_yi 发表于 2022-8-14 21:10
实验是在溶剂中做的吧?加上溶剂化效应再算一下。
但是我觉得即使加上溶剂化效应,A1、A2的结合能差距会缩 ...

谢谢您的回复。

电荷没有问题,那作用能为正,是代表这个体系不能稳定存在的意思了吗,那跟实验不一样呢,不知道如何解释?或者有没有其他计算方法
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ginlpein    时间: 2022-8-16 22:17
做BSSE了吗?你这每一个计算的机组都不一般大吧。
另外你的能量量级没问题吗?你这负的数值相当于两倍碳碳单键键能还有余了,你这配位键有这么稳定吗?同理正的数值绝对值也和碳碳单键一个量级了,这有点怪吧?




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