计算化学公社

标题: 请问大家如何回答审稿人用gaussian计算而不用vasp计算？ [打印本页]

作者
Author: dingniu2 时间: 2022-8-19 22:38
标题: 请问大家如何回答审稿人用gaussian计算而不用vasp计算？
请问大家截取石墨碳作为碳材料模型，中心用过渡金属原子掺杂，中心外围也有2-3圈苯环，边界以氢原子饱和，做中心过渡金属催化化学反应机理。这种截取模型做能带态密度等关于材料整体性质的研究不行，但是截取模型做局部催化反应机理也有很多文献可以参考，另外gaussian做过渡态较好、可选泛函和基组较多。但是该如何回答审稿人用gaussian计算而不用vasp周期模型计算？有没有研究测试过单纯研究局部活性位点催化反应机理用gaussian和用vasp对结论不会产生较大影响的文献？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-19 23:04
把你帖子里对Gaussian优点的描述写给审稿人，再引用一些像样期刊里用簇模型做量子化学研究这类体系的文献就行了

另外，用Gaussian或ORCA等量化程序计算后还可以结合Multiwfn做丰富的波函数分析，而且还可以用更好的双杂化泛函。

作者
Author: dingniu2 时间: 2022-8-19 23:15

sobereva 发表于 2022-8-19 23:04
把你帖子里对Gaussian优点的描述写给审稿人，再引用一些像样期刊里用簇模型做量子化学研究这类体系的文献就 ...

谢谢sob老师，有些不知道说的对不对，gaussian做过渡态真的比vasp有优势吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-19 23:21

dingniu2 发表于 2022-8-19 23:15
谢谢sob老师，有些不知道说的对不对，gaussian做过渡态真的比vasp有优势吗？

我不用VASP。我只能说对于找过渡态这个问题本身，Gaussian是公认的所有程序里成熟度最顶级的，找过渡态十分稳健且便利（当然，使用者不能没基本常识），也是其最大长处之一，本身Gaussian开发者之一Schlegel就是优化方面算法的大牛。其它很多有名的程序在这方面和Gaussian比都显得欠打磨。

另外，Gaussian相比VASP还有个好处是可以做柔性扫描、冗余内坐标的限制性优化，帮助确定难找的过渡态的过渡态初猜很有帮助。
而且Gaussian还能做波函数稳定性测试，这是VASP不具备的。原理上这可以令Gaussian的计算结果更稳妥可信。Gaussian计算时还用不着考虑偶极校正、设置真空区、需要盒子呈电中性（或额外的特殊处理）这些琐事。
Gaussian还有GaussView，在编辑结构，监控计算，可视化振动模式和IRC上也更为方便。

作者
Author: dingniu2 时间: 2022-8-20 15:46

sobereva 发表于 2022-8-19 23:21
我不用VASP。我只能说对于找过渡态这个问题本身，Gaussian是公认的所有程序里成熟度最顶级的，找过渡态十 ...

谢谢老师，这样回复审稿人合理，要是能有个benchmark文献研究两者对计算结果影响大小就好了。

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