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标题: 计算液相中OH的均方位移MSD，但是OH很容易变成H2O怎么办？ [打印本页]

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Author: 九月九 时间: 2022-8-22 18:02
标题: 计算液相中OH的均方位移MSD，但是OH很容易变成H2O怎么办？
各位老师好！我通过跑MD计算碱性溶液中OH的均方位移，但是OH很容易就夺取H（其它H2O中的H）变成H2O，请问这种情况怎么计算OH的MSD呢？谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-23 12:41
如果你是用的从头算动力学，写脚本处理轨迹，判断出哪些OH-是可以存在一段时间的，对于存在了一段时间的OH-计算MSD。并恰当考虑同类离子的平均和时间平均

作者
Author: 九月九 时间: 2022-8-24 10:58

sobereva 发表于 2022-8-23 12:41
如果你是用的从头算动力学，写脚本处理轨迹，判断出哪些OH-是可以存在一段时间的，对于存在了一段时间的OH- ...

我试试看，谢谢sob老师！

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