计算化学公社

标题: 用gaussian给本科生上计算化学实验课有哪些合适的化学反应体系？ [打印本页]

作者
Author: dali 时间: 2022-8-23 23:00
标题: 用gaussian给本科生上计算化学实验课有哪些合适的化学反应体系？
科研接触的体系即耗时又复杂，不适合用来教学。请问大家有哪些推荐的化学反应体系适合用gaussian给本科生上计算化学实验课，热力学方面和动力学过渡态方面的，内容丰富即不太难又不要太过于简单。

作者
Author: flyingchow 时间: 2022-8-24 08:28
DA反应，太经典的例子了。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-24 09:16
氢迁移

作者
Author: exity 时间: 2022-8-24 12:51
紫外吸收光谱，又好算，又方便对比实验

作者
Author: 冰释之川 时间: 2022-8-24 12:54
DA, HAT这两类反应比较容易定位过渡态结构

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2022-8-24 23:01
本帖最后由北大-陶豫于 2022-8-26 11:47 编辑

我以前写过理论计算上机课的讲义，过渡态搜索方面，我找了这几个例子我认为是比较合适的：
柔性扫描方法：丁二烯顺反异构化
固定优化方法：丁二烯与乙烯DA
直接在较高对称性下优化：氨翻转
QST2：丙酮互变异构

作者
Author: dali 时间: 2022-8-25 08:32

sobereva 发表于 2022-8-24 09:16
氢迁移

谢谢老师，请问如果选霍夫曼重排反应中的氢迁移会不会太复杂，还有哪些适合体系的氢迁移反应吗？谢谢！

作者
Author: dali 时间: 2022-8-25 08:33

北大-陶豫发表于 2022-8-24 23:01
我以前写过理论计算上机课的讲义，过渡态搜索方面，我找了这几个例子我认为是比较合适的：柔性扫描方法：丁 ...

这个太好了，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-25 09:14

dali 发表于 2022-8-25 08:32
谢谢老师，请问如果选霍夫曼重排反应中的氢迁移会不会太复杂，还有哪些适合体系的氢迁移反应吗？谢谢！

HCN -> CNH属于hello world的过渡态搜索例子

作者
Author: hipship 时间: 2022-8-25 09:15
这个资源真不错！

作者
Author: reid 时间: 2022-9-1 01:03
必须点赞！现在量化计算越来越重要了

作者
Author: yflchx 时间: 2022-9-3 17:30
SN2反应，

应该是有机一上来就学的反应。

作者
Author: hxd_yi 时间: 2022-9-4 21:07
本帖最后由 hxd_yi 于 2022-9-4 21:08 编辑

我再补充一个pka和BDE。
环戊二烯是个好东西，可以算pka，还可以算DA反应，还有各种过渡金属络合物，可以和课本知识对应起来。
各种简单化合物简单基团的BDE，比如叠氮根解离成氮原子和氮气。

作者
Author: xvguang 时间: 2022-9-27 15:29
我是来学习的

作者
Author: Billhenry 时间: 2022-10-12 20:15

北大-陶豫发表于 2022-8-24 23:01
我以前写过理论计算上机课的讲义，过渡态搜索方面，我找了这几个例子我认为是比较合适的：
柔性扫描方法： ...

感谢分享

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2022-10-12 21:19

hxd_yi 发表于 2022-9-4 21:07
我再补充一个pka和BDE。
环戊二烯是个好东西，可以算pka，还可以算DA反应，还有各种过渡金属络合物，可以 ...

溶液中的pKa算准到对实验有用的程度很困难，主要误差来自于溶剂效应。

从实用的角度，我不太建议介绍BDE，甚至反而应该discourage使用BDE讨论问题。这东西第一算起来很简单、真的需要时自己很容易学会，第二是实在被滥用、过誉了。有机化学家喜欢拿BDE分析问题是因为早年缺乏成熟计算工具，只能用BDE去估算，但很多反应体系中BDE的大小和反应活性的相关性很差，现在讨论问题应该做更直接的事情，比如优化过渡态。

作者
Author: hxd_yi 时间: 2022-10-15 16:27

liyuanhe211 发表于 2022-10-12 21:19
溶液中的pKa算准到对实验有用的程度很困难，主要误差来自于溶剂效应。

从实用的角度，我不太建议介绍B ...

算pka和bde就是为了展示你说的问题。这两者数据相对丰富很多，更方便和实验数据对比，知道误差来源。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)