计算化学公社

标题: 课题组购采购计算电脑，预算10万以内，请教一下大概的配置 [打印本页]

作者
Author: Celeborn 时间: 2022-8-24 22:43
标题: 课题组购采购计算电脑，预算10万以内，请教一下大概的配置
实验组，主要用vasp做计算，经常算几十至一百多个原子体系的能带和声子谱，比较耗费CPU和内存，有时还要考虑SOC。配了新电脑后可能还会算算三阶力常数。
目前是拿一台Ryzen 3960X + 192G 内存的电脑在算，一次只能跑一个任务，速度也慢。
现在预算10万以内配一台工作站，向前辈们请教下配置（CPU、主板、内存、散热器、电源等），十分感谢！
此外，还想请教下，这个预算是不是可以考虑用GPU版vasp算？

作者
Author: abin 时间: 2022-8-24 23:38
GPU，negative 。

8375C双路两台，
IB 56Gbps直连。

系统盘120G固态两个。
8TB机械两个，一个存放数据，一个备份。
两个NVMe做RAID0。或者一个PCIe 4.0接口固态。
如果是纯跑vasp，NVMe固态可不要。

根据实际预算调整内存容量。
两台机器，需要32个内存条。

完。

参考
【迷你集群vasp并行计算-哔哩哔哩】 https://b23.tv/IbKx2cz

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-25 09:06
看里面双路8375C的配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

10万都能买3台了

作者
Author: Celeborn 时间: 2022-8-25 14:48

abin 发表于 2022-8-24 23:38
GPU，negative 。

8375C双路两台，

谢谢大佬指教。
还有点不太明白，请问 “两个NVMe做RAID0。或者一个PCIe 4.0接口固态。”，这两个东西有什么作用？

作者
Author: Celeborn 时间: 2022-8-25 14:48

sobereva 发表于 2022-8-25 09:06
看里面双路8375C的配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

大概清楚怎么配了，谢谢社长指教。

作者
Author: abin 时间: 2022-8-25 15:32
本帖最后由 abin 于 2022-8-25 15:34 编辑

Celeborn 发表于 2022-8-25 14:48
谢谢大佬指教。
还有点不太明白，请问 “两个NVMe做RAID0。或者一个PCIe 4.0接口固态。”，这两个东西有 ...

你的计算如果涉及到疯狂读写硬盘的话,
那么, 低规格, PCIe 4.0 规格的NVMe 固态硬盘一个, 容量看预算和需求决定.

如果预算很足, 可以考虑;
两个PCIe 4.0 规格NVMe固态硬盘, 做RAID0来提升并发读写性能.

只跑MD的话, 似乎用不到快速读写.

但是部分量化计算任务, 能用到的.
另, 如果是两个机器使用IB连起来做并行计算,
两台机器使用一套大硬盘就行了.
另一台, 只有一个系统硬盘即可.

更多讯息, 可以查阅 http://t.csdn.cn/hHUgs

作者
Author: Celeborn 时间: 2022-8-25 16:07

abin 发表于 2022-8-25 15:32
你的计算如果涉及到疯狂读写硬盘的话,
那么, 低规格, PCIe 4.0 规格的NVMe 固态硬盘一个, 容量看预算和 ...

好的，谢谢大佬。

作者
Author: savorw 时间: 2022-9-26 15:50

sobereva 发表于 2022-8-25 09:06
看里面双路8375C的配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

请教下，在你的顶级双路服务器推荐配置中建议插16条内存才能把内存通道全都利用上，那同样的256G内存配置，是32G*8条快还是16G*16条快？按说单根容易更大读写速度更快，但内存通道全用又应该会更高，所以不知这两种哪一种更好。但如果经费充足，是不是配成32G*16条优于上面两种情况？

作者
Author: Satoru 时间: 2022-9-26 16:46

savorw 发表于 2022-9-26 15:50
请教下，在你的顶级双路服务器推荐配置中建议插16条内存才能把内存通道全都利用上，那同样的256G内存配置 ...

单条的容量和速度我印象里没有关系吧...忘了在哪里读到过，单条内存越大，延迟似乎会稍有提高

所以说32G*8速率和16G*8差不多（都不写满的情况），二者显然小于16G*16

作者
Author: savorw 时间: 2022-9-26 17:43

Satoru 发表于 2022-9-26 16:46
单条的容量和速度我印象里没有关系吧...忘了在哪里读到过，单条内存越大，延迟似乎会稍有提高

所以说3 ...

网上查到的数据是，相同通道下，内存容量大的稍微比其一半容量的快一点，但不明显。所以感觉应该是否应为32G*16稍微>16G*16>32G*8, 因没条件具体测试过。故来求证。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-27 06:03

savorw 发表于 2022-9-26 17:43
网上查到的数据是，相同通道下，内存容量大的稍微比其一半容量的快一点，但不明显。所以感觉应该是否应为 ...

32GB*16和16GB*16的速度没明显差异，没必要顾虑这个

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