计算化学公社

标题: GROMACS将小分子牵引过细胞膜出现牵引方向相反的问题 [打印本页]

作者
Author:
熊小熊    时间: 2022-8-26 10:52
标题: GROMACS将小分子牵引过细胞膜出现牵引方向相反的问题
请假一下各位朋友,我想使用GROAMCS 牵引将小分子牵引过细胞膜,但是一直出现牵引方向相反的问题,尝试过将rate改为负数,还是实现不了,想请教一下在不改变系统大小的情况下可以怎样处理,谢谢!

作者
Author:
sobereva    时间: 2022-8-26 13:54
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “GROMACS 、小分子过膜” 改了,以后务必注意

mdp不完整
如果用了消除整体平动的设置,先关了
作者
Author:
熊小熊    时间: 2022-8-26 20:12
收到,后面注意,我去除了部分组的平动,我先删除试试,谢谢老师。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3