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标题: 绘制晶体的范德华势等值面图,做出来的等值面图中只看到了结构,没看到等值面 [打印本页]

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wanlichuan    时间: 2022-8-30 12:44
标题: 绘制晶体的范德华势等值面图,做出来的等值面图中只看到了结构,没看到等值面
根据《551-谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制》绘制晶体的范德华势等值面图,做出来的等值面图中只看到了结构,没看到等值面。即使把cube文件拷到VMD中通过《483-VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法》方法也看不到等值面。通过cubiso调整等值面数值非常小也不行。
尝试了多个晶体结构,都不成功。用文中社长提供的MOF5.cif能够成功。
不知道原因在哪儿,请高手帮忙看一下。
上传了两个晶体结构AGONES.cifBIMYEE.cif。

操作过程完全按照551帖子中的步骤,见附录txt文件。



作者
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sobereva    时间: 2022-8-30 18:26
你的体系中晶胞都被原子堆满了,没有空白区域,范德华势自然没地方显示




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