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标题: Charmm gui构建膜蛋白-配体体系 Replicate System进程报错 [打印本页]

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Author: kopertqqq 时间: 2022-8-30 13:54
标题: Charmm gui构建膜蛋白-配体体系 Replicate System进程报错
本帖最后由 kopertqqq 于 2022-8-30 16:32 编辑

本人通过Charmm gui构建膜蛋白-配体体系，然后在GROMACS中进行模拟，蛋白选取的是我前期实验筛选的一段序列，配体是去镁叶绿素a（因为加镁叶绿素分析配体参数的时候Charmm gui会报错），脂质用的是DPPC，配体类型是GAFF，目前可以顺利进行到组装体系这一步。接下来一步Charmm gui显示的是Replicate System，然后点击下一步后会出现报错信息，进程中止。蛋白配体图和pdb文件，Replicate System界面，膜体系图以及报错信息文档如下，由于报错信息太长，所以整理到了txt文档里，其中报错信息中的警告写的是：
***** LEVEL 0 WARNING FROM *****

***** No atoms selected for deletion. Nothing done.

请各位老师和朋友们看一下该如何解决，谢谢大家。

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