计算化学公社

标题: 用VMD分析动力学模拟的RDF的问题求助 [打印本页]

作者
Author:
yangzhanlin    时间: 2022-8-31 17:09
标题: 用VMD分析动力学模拟的RDF的问题求助
老师们好,我初学动力学模拟有个疑问向各位老师请教。假如我模拟A和B的混合溶液,A和B中都含有O原子,我想知道某元素与A中O原子的RDF,但是我用VMD进行分析时选择type O的时候是把体系O原子全部选中了,这种问题怎么解决?感谢各位老师。
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-8-31 19:24
如果A和B的残基名不同,结合resname进行选取,参看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html




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