计算化学公社

标题: 求助如何获得某一视角的四元方位信息 [打印本页]

作者
Author: Yongdatasci 时间: 2022-9-16 16:23
标题: 求助如何获得某一视角的四元方位信息
各为老师

我想试着做衍射图, 需要某一特定视角的四元方位信息(quaternion of global orientation).

在VMD下我转到那个特定视角, 请问有没有方法获得这个参数?

不胜感激.

作者
Author: Frozen-Penguin 时间: 2022-9-16 21:51
保存.vmd文件，里面有视角的信息，用矩阵表示的

作者
Author: Yongdatasci 时间: 2022-9-17 11:37

Frozen-Penguin 发表于 2022-9-16 21:51
保存.vmd文件，里面有视角的信息，用矩阵表示的

感谢您的回复, 查看.vmd文件之后找到了矩阵, 之后发现下面这个命令可以在console中得到该矩阵

`molinfo top get {rotate_matrix}`

得到的是4×4的矩阵, 而衍射软件中需要的是1×4的矩阵, 目前还不清楚两者如何转化

您知道怎么处理吗, 谢谢

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