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标题: amber16使用sander.MPI运行最小化报错 [打印本页]

作者
Author: fuchg 时间: 2022-9-17 18:05
标题: amber16使用sander.MPI运行最小化报错
本帖最后由 fuchg 于 2022-9-18 13:58 编辑

各位老师，我使用amber16中的sander.MPI进行最小化，但是出现了如下所示的错误：
(, 下载次数 Times of downloads: 25)
下面是我的运行命令及in文件：
运行命令：mpirun -np 5 sander.MPI -O -i ../in/min1.in -o min1.out -p ../com_l122sep.prmtop -c ../com_l122sep.inpcrd -r min1.rst -ref ../com_l122sep.inpcrd
(, 下载次数 Times of downloads: 23)
但是同样的命令和in文件其他的体系就可以运行，请问这是什么原因呢？
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-17 18:43
不要自己在标题上写[Amber]这种标签，给你去掉了，以后注意

作者
Author: fuchg 时间: 2022-9-17 19:16

sobereva 发表于 2022-9-17 18:43
不要自己在标题上写[Amber]这种标签，给你去掉了，以后注意

好的，谢谢老师

作者
Author: casea 时间: 2022-9-18 08:36
得看你的out文件，有可能是限制出错了

作者
Author: fuchg 时间: 2022-9-18 13:59

casea 发表于 2022-9-18 08:36
得看你的out文件，有可能是限制出错了

您好，我重新查看了我的out文件，没有找到明显的报错，我重新上传了我的out文件，您能帮我看一下吗？

作者
Author: casea 时间: 2022-9-18 14:57

fuchg 发表于 2022-9-18 13:59
您好，我重新查看了我的out文件，没有找到明显的报错，我重新上传了我的out文件，您能帮我看一下吗？

将restraint_wt设的大一点看看,比如说设为150

作者
Author: fuchg 时间: 2022-9-18 22:52

casea 发表于 2022-9-18 14:57
将restraint_wt设的大一点看看,比如说设为150

好的，老师，我尝试一下，谢谢

作者
Author: 阿志 时间: 2022-9-19 09:43

casea 发表于 2022-9-18 14:57
将restraint_wt设的大一点看看,比如说设为150

老师，您好，我想问一下，restaraint_wt，这个参数应该根据什么标准来确定值是多少？

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