计算化学公社

标题: OpenMPI并行计算提示错误 [打印本页]

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Author: geyichao 时间: 2022-9-19 21:37
标题: OpenMPI并行计算提示错误
你好，我按量子化学程序ORCA的安装方法 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com) 这个链接里的提示，编译安装OpenMPI，以单线程运行ORCA时没有问题的，证明OpenMPI和ORCA安装上没有问题。但一旦使用多线程，则会提示No OpenFabrics connection schemes reported that they were able to be used on a specific port. As such, the openib BTL (OpenFabrics support) will be disabled for this port. 不知该怎么解决？先谢谢了。 (, 下载次数 Times of downloads: 68)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-20 01:49
把No OpenFabrics connection schemes reported that they were able to be used on a specific port报错放Google里搜

作者
Author: abin 时间: 2022-9-20 06:53
如果搞不定的话，搜索我的贴文，
下载即用，无其他依赖。

作者
Author: geyichao 时间: 2022-9-20 15:14
有看到说，在环境变量中加入export OMPI_MCA_btl_openib_if_exclude=mlx4_0:X，其中最后一个数字X与提示的问题描述中的mlx4_0Local port: 一致

参考网站--https://arc.umich.edu/mpi-on-foe

虽然不提示错误了，但有1/3的概率会提示ORCA finished by error termination in SCF错误，感觉像是进程被中止（内存没有超限）。相同的配置文件在其他电脑运行正常。

目前使用楼下abin的singularity方案，暂时没有发现问题。

作者
Author: geyichao 时间: 2022-9-20 15:14

abin 发表于 2022-9-20 06:53
如果搞不定的话，搜索我的贴文，
下载即用，无其他依赖。

谢谢。。目前已经使用上您的singularity方案了，暂时没有发现问题。

作者
Author: hebrewsnabla 时间: 2022-9-20 16:02
单核运行ORCA没有问题并不能说明openmpi安装没问题（当然我也不是说一定有问题），因为orca可执行程序有两份，单核的时候执行的那一份是完全没有调用openmpi的（不安装openmpi也可以运行）

作者
Author: geyichao 时间: 2022-9-20 16:26

hebrewsnabla 发表于 2022-9-20 16:02
单核运行ORCA没有问题并不能说明openmpi安装没问题（当然我也不是说一定有问题），因为orca可执行程序有两 ...

其实我也觉得问题出在OpenMPI上，但我尝试安装OpenMPI 4.1.1~4.1.4，在编译和安装都成功的情况下，还是有这个问题（ORCA 5.0.3）

作者
Author: abin 时间: 2022-9-20 16:29
对于vasp orca Dalton 等，
我提供的开箱即用模式，
都默认开启了IB模式的支持，以及其他一些高性能计算支持。

能用就好。

记得去ORCA站点多下载几次，为开发者助力。

作者
Author: geyichao 时间: 2022-9-20 16:31

abin 发表于 2022-9-20 16:29
对于vasp orca Dalton 等，
我提供的开箱即用模式，
都默认开启了IB模式的支持，以及其他一些高性能计算 ...

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