zhouoh 发表于 2022-9-21 05:24
不知道具体跑MD速度咋样,30系也是说FP32翻倍,结果速度提升也就那样。
zhouoh 发表于 2022-9-21 05:50
问题是用纯GPU方案的amber和openmm提升也不到一倍。我这里一个蛋白体系,2080ti大概200ns/day,3080ti 也才 ...
Entropy.S.I 发表于 2022-9-21 05:33
30系相较于20系,FP32翻1倍以上,实际跑MD速度恰好翻1倍。测出来不翻倍是因为CPU有瓶颈,要让3090跑GMX的 ...
sun35mr 发表于 2022-9-25 21:49
我今年换成 3060Ti,结果用gpu跑lammps的速度也就比之前的960 4g快了不到1倍,cpu是R5 2600,是因为CPU到 ...
八月的雨季 发表于 2022-9-26 11:04
翻不了倍的,很直观的对比,我的膜蛋白体系10W原子左右,Amber纯GPU跑,2080ti 70~80 ns一天,1080ti 40~50 ...
Entropy.S.I 发表于 2022-9-21 05:33
30系相较于20系,FP32翻1倍以上,实际跑MD速度恰好翻1倍。测出来不翻倍是因为CPU有瓶颈,要让3090跑GMX的 ...
Picardo 发表于 2022-9-29 13:43
请问这个cpu的瓶颈是主频还是核数还是带宽什么的,没用过gromacs,lammps的话,用gpu跑的话,我参照别人 ...
Entropy.S.I 发表于 2022-9-29 18:39
GPU加速GMX,启用-update gpu后,CPU负载主要是每n(n为正整数,通过mdp文件指定)步收集一次GPU上跑出来的 ...
Picardo 发表于 2022-10-9 17:31
谢谢赐教,具体我也不太清楚,
Entropy.S.I 发表于 2022-10-13 18:57
最近亲自试了Lammps,确实是用1核带1卡比较合适,误导你了,抱歉…
Picardo 发表于 2022-10-15 10:31
没有啥误导,我也不是很清楚,我自己没测试过,听油管上别人说的
gog 发表于 2022-10-18 21:33
用不用nvlink,都不重要了。高端计算加速卡,不准销往中国。得绕道了。玩游戏和办公,以及lammps计算,支 ...
Picardo 发表于 2022-10-21 11:11
我的意思是游戏显卡有支持nvlink的嘛,
gog 发表于 2022-10-18 21:33
用不用nvlink,都不重要了。高端计算加速卡,不准销往中国。得绕道了。玩游戏和办公,以及lammps计算,支 ...
beowulf 发表于 2023-1-23 17:30
A100都有官方的A800作为替代了,到时候H100去越南、马来西亚一带洗个澡一样的。
办法总比困难多的。
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