计算化学公社
标题:
gromacs如何在verlet截断下排除能量组内部的相互作用
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作者Author:
Rosefinch
时间:
2022-9-23 16:30
标题:
gromacs如何在verlet截断下排除能量组内部的相互作用
本人在进行石墨表面二维分子自组装的MD模拟时,因石墨基底的原子数量巨大,通常将石墨冻结住,同时想利用 energygrp_excl 来排除其内部的相互作用,但这个关键词与verlet截断相互冲突,会出现 “Energy group exclusions are not (yet) implemented for the Verlet scheme” 这样的报错,想请问各位老师我该如何设置才能排除石墨基底内部相互作用的计算减轻计算量?
作者Author:
sobereva
时间:
2022-9-24 00:22
如果目前最新版也这样提示,那就没辙了。通常来说也不至于石墨烯的原子会非常多
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