计算化学公社

标题: 求助：碳纳米管结晶过程中报错 [打印本页]

作者
Author: 吧唧爱吃糖 时间: 2022-9-23 18:51
标题: 求助：碳纳米管结晶过程中报错
各位前辈，我是想在碳纳米管中结晶，但是在进行的过程中出现了报错
Setting the number of thread-MPI ranks is only supported with thread-MPI and
GROMACS was compiled without thread-MPI

我也检查了初始的结构没有问题，不知道是不是因为体系太小的问题，下面给出我的文件。希望各位前辈指点，感激不尽。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-23 23:47
跟输入文件没直接关系
提示里写了，当前GROMACS编译时没启用thread-MPI。
如果当前机子是MPI版GROMACS，按下文重新编译。单机运行绝对不要用MPI版
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

作者
Author: 吧唧爱吃糖 时间: 2022-9-24 10:50

sobereva 发表于 2022-9-23 23:47
跟输入文件没直接关系
提示里写了，当前GROMACS编译时没启用thread-MPI。
如果当前机子是MPI版GROMACS， ...

老师您好，感谢您的回复，但是我用的是超算中心计算的，没办法编译怎么办那？

作者
Author: 含光君 时间: 2022-9-24 12:31
mpirun -np 4 gmx_mpi mdrun

此贴写的很清楚（http://bbs.keinsci.com/thread-13861-1-1.html）

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)