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标题: Multiwfn轨道分析结果与VMD图中红色蓝色部分的联系 [打印本页]

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lei234    时间: 2016-5-10 11:58
标题: Multiwfn轨道分析结果与VMD图中红色蓝色部分的联系
用Multiwfn分析轨道组成,操作8,1,最后会得到Composition of each atom,该结构中贡献最大的四个原子如图1所示,用VMD得到的图形如图2所示,似乎图1中贡献最大的4个原子是图2中蓝色部分,这两者之间有什么联系吗?用Multiwfn得到的轨道组成信息和VMD中作出的图如何对应起来呢?红色部分和蓝色部分除了代表正相位和负相位之外,有什么化学意义吗?
@sobereva
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杨小狗    时间: 2016-5-11 09:14
请问您关于原子所占组分的计算的具体步骤或者manual上的哪里?这个问题我也很关注 谢谢
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lei234    时间: 2016-5-11 11:59
杨小狗 发表于 2016-5-11 09:14
请问您关于原子所占组分的计算的具体步骤或者manual上的哪里?这个问题我也很关注 谢谢

没读懂你的问题。。。
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liyuanhe211    时间: 2016-5-11 12:03
你这画的是分子轨道的两个相位?不大信呢,哪有分子轨道像这样的。
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lei234    时间: 2016-5-13 08:02
liyuanhe211 发表于 2016-5-11 12:03
你这画的是分子轨道的两个相位?不大信呢,哪有分子轨道像这样的。

可确实画出来是这样的呀,是按照帖子里的教程画的,您觉得哪里有问题呢?是红色和蓝色在不同的原子上吗?其它也有类似的情况,我不知道该怎么分析了,还请赐教~~
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sobereva    时间: 2016-5-14 18:22
lei234 发表于 2016-5-13 08:02
可确实画出来是这样的呀,是按照帖子里的教程画的,您觉得哪里有问题呢?是红色和蓝色在不同的原子上吗? ...

你用Multiwfn主功能0来把那个轨道画出来,截个图我看一下
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sobereva    时间: 2016-5-14 18:23
杨小狗 发表于 2016-5-11 09:14
请问您关于原子所占组分的计算的具体步骤或者manual上的哪里?这个问题我也很关注 谢谢

手册4.8节有大量的例子,也可以看
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131
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lei234    时间: 2016-5-15 01:59
sobereva 发表于 2016-5-14 18:22
你用Multiwfn主功能0来把那个轨道画出来,截个图我看一下

找到问题了,是我在画图的时候没有把两个Isosurface选到同一个轨道,一个Isosurface选的是HOMO轨道的,一个Isosurface选的是LUMO轨道的。。。




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