计算化学公社

标题: 动力学模拟如何计算反应过程中每一刻的能量分布？ [打印本页]

作者
Author: PESPES 时间: 2022-9-23 21:51
标题: 动力学模拟如何计算反应过程中每一刻的能量分布？
针对HO-+CH3I进行了动力学模拟，得到了反应轨迹中每一点的坐标和动量，应该如何求反应中的振动、转动和相对平动能的？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-23 22:06
根据原子速度矢量，投影出整体平动、转动速度并得到平动能和转动能，动能中扣除这两部分可以算作振动动能。
诸如Gaussian做BOMD最后会输出平动/转动/振动动能，感兴趣可以看看代码

作者
Author: PESPES 时间: 2022-9-23 22:14

sobereva 发表于 2022-9-23 22:06
根据原子速度矢量，投影出整体平动、转动速度并得到平动能和转动能，动能中扣除这两部分可以算作振动动能。 ...

请问社长，Gaussian中做BOMD最后会输出平动/转动/振动动能只是产物的能量分布么？具体代码在哪里可以查到呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-23 23:45

PESPES 发表于 2022-9-23 22:14
请问社长，Gaussian中做BOMD最后会输出平动/转动/振动动能只是产物的能量分布么？具体代码在哪里可以查到 ...

是。算每一帧的话需要自己写程序
把输出信息中的关键字符串在源代码里搜，顺藤摸瓜就能找到计算代码

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