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标题: 各位大佬,我想模拟结晶水合盐的升温相变过程,用lammps选择GAFF力场可以吗? [打印本页]

作者
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okn    时间: 2022-9-25 08:15
标题: 各位大佬,我想模拟结晶水合盐的升温相变过程,用lammps选择GAFF力场可以吗?
echo           screen
units          real
dimension     3
boundary       p p p
atom_style     full

pair_style     lj/cut/coul/long 8.0 12.0
kspace_style   pppm 1.0e-4
bond_style     harmonic
angle_style    harmonic
dihedral_style charmm
special_bonds  amber
improper_style cvff


作者
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okn    时间: 2022-9-25 08:20
我看一些文献,GAFF力场与AMBER力场形式完全一样,特别是LJ势参数也是一样,我想问一下我上边的bond_style/angle_style等设置正确吗?
作者
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tjuptz    时间: 2022-9-25 08:59
传统力场对盐的表现不行,相变估计更不行了。看看文献用的啥吧
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okn    时间: 2022-9-25 14:39
tjuptz 发表于 2022-9-25 08:59
传统力场对盐的表现不行,相变估计更不行了。看看文献用的啥吧

感谢回复,我看了一些对于有机盐来说,MD模拟不是很多,有几篇是利用的GAFF力场,还有些是用direding力场和GROMOS 54a8-FF。我现在刚开始学,找到了GAFF力场的势参数。想让大佬看看我的in文件编写对不对?




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