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标题: Materials Project下载cif文件时Conventional Standard, Symmetrized等区别和含义？ [打印本页]

作者
Author: nusiew 时间: 2022-9-26 09:34
标题: Materials Project下载cif文件时Conventional Standard, Symmetrized等区别和含义？
本帖最后由 nusiew 于 2022-9-26 09:53 编辑

从Materials Project上下载cif文件时有（1）Computed、（2）Conventional Standard、（3）Primitive Cell、（4）Symmetrized这四种晶体结构可供选择。（1）Computed是指计算优化过的晶胞，后面Calculation Summary中有具体的计算信息。请问其余的三种cif晶体结构有什么区别？具体的含义分别是什么？谢谢大家！

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作者
Author: 含光君 时间: 2022-9-26 11:44
Primitive Cell 是晶体最小的重复单元，
Conventional Cell 是视觉上具有更好对称性，但非最小重复单元。
举个例子，我们熟悉的NaCl晶体：下面这个平常见的更多的是Conventional Cell，每个晶胞中含4个Na离子和4个Cl离子
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而下面这个就是Primitive Cell，每个晶胞中只含1个Na离子和1个Cl离子
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至于Symmetrized，个人觉得下载下来晶胞中原子位置是和Conventional Cell一样的，但是cif文件里会额外说明晶胞的空间点群。
NaCl的Conventional Cell与Symmetrized Cell cif文件对比如图：

(, 下载次数 Times of downloads: 49)

作者
Author: nusiew 时间: 2022-9-30 19:55
本帖最后由 nusiew 于 2022-9-30 19:57 编辑

含光君发表于 2022-9-26 11:44
Primitive Cell 是晶体最小的重复单元，
Conventional Cell 是视觉上具有更好对称性，但非最小重复单元。
...

非常感谢指导！请问为啥同一种晶体结构，除了Conventional Standard 和 Symmetrized一致外，它们与Primitive Cell 和 Computed的晶格参数差异为啥这么大，究竟用哪种呢？

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作者
Author: 含光君 时间: 2022-10-1 01:07
本帖最后由含光君于 2022-10-1 01:11 编辑

我觉得这个问题可以这么考虑：
拿二维点阵举个栗子，我们考虑这个点阵的最小重复单元，括出一个cell，方法其实并不是唯一的，

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可以画成矩形也可以画成菱形，不同的画法对应的晶格参数（a,b,α,β）是不一样的。但它们的cell volume（这里是面积），以及每个cell中包含的原子数实际上是一致的。
推广到三维情况也是如此，你所列举的computed和primitive cell里面都是包含了4个Fe和6个O，cell volume相似，可能计算过后会优化一下晶胞参数，
然后你去量结构里面的键长键角二面角应该也不会差太多，所以它俩近乎是等效的，即使是primitive cell应该也接近于优化完的结构了。

作者
Author: zhaojingjing 时间: 2024-1-25 10:04

nusiew 发表于 2022-9-30 19:55
非常感谢指导！请问为啥同一种晶体结构，除了Conventional Standard 和 Symmetrized一致外，它们与[/back ...

你好，你这个图片是在哪里可以看呢

作者
Author: nusiew 时间: 2024-2-25 18:47

zhaojingjing 发表于 2024-1-25 10:04
你好，你这个图片是在哪里可以看呢

最新网址：https://next-gen.materialsproject.org/

作者
Author: Superginger 时间: 2024-5-30 15:47

含光君发表于 2022-9-26 11:44
Primitive Cell 是晶体最小的重复单元，
Conventional Cell 是视觉上具有更好对称性，但非最小重复单元。
...

您好，想问除了”computed“文件之外的其他三个文件是进行对应结构优化计算所使用的初始实验数据吗？还是已经通过结构优化计算得到的数据呢？

作者
Author: youknowdcf 时间: 2025-10-24 19:43

含光君发表于 2022-10-1 01:07
我觉得这个问题可以这么考虑：
拿二维点阵举个栗子，我们考虑这个点阵的最小重复单元，括出一个cell，方法 ...

您好，我想请教一下，我下载cif文件是用于切面以进行DFT/MD计算的，选择computed和conventional的进行相同的切面操作得到的是相同的吗？正确的操作应该是选择哪种cif去切割呢？

作者
Author: 含光君 时间: 2025-10-27 09:23

youknowdcf 发表于 2025-10-24 19:43
您好，我想请教一下，我下载cif文件是用于切面以进行DFT/MD计算的，选择computed和conventional的进行相 ...

第一个问题，不知道具体的两个结构长什么样不太好判断，

我觉得可以用conventional切，如果你的conventional结构也是α=β=γ=90°的话，这样切直观一些。

作者
Author: youknowdcf 时间: 2025-10-27 16:54

含光君发表于 2025-10-27 09:23
第一个问题，不知道具体的两个结构长什么样不太好判断，

我觉得可以用conventional切，如果你的conven ...

谢谢，我后面也是选择了conventional的，正交的切割后面算MD比较方便。

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