计算化学公社

标题: 手贱升级到rockylinux 9,给后来人一点经验。 [打印本页]

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牧生    时间: 2022-9-28 11:54
标题: 手贱升级到rockylinux 9,给后来人一点经验。
本帖最后由 牧生 于 2022-11-26 15:25 编辑

一时手贱,安装了rockylinux 9,无数的槽点。

1、rockylinux 9自带的gcc版本非常高,到了gcc 11.2.1,导致大批旧软件无法安装。(想手动降低gcc,但试了几次,没成功,反而还把系统搞崩了。但激起了我的好胜心,我一定要用上rockylinux 9)

2、安装Tweaks以后,无法成功安装并使用extension-dash-to-dock,感觉就很不方便。在这里可以找到可用的扩展https://extensions.gnome.org/,必须首先使用firefox安装gnome-shell插件,然后安装别的插件,比如熟悉的window list。

3、稍旧的驱动和cuda都无法安装,必须使用很新的驱动和cuda,我装的驱动是515.76版本,cuda11.6。

4、gmx的旧版无法安装,试过2021.6,都不能安装,必须安装新版,我被迫安装了最新的gmx 2022.3




总结:没有金刚钻,别揽瓷器活,如果不是非常非常必要,不要用rockylinux 9



2022.11.26   按照这里应该可以降级gcc,但我还没试过http://bbs.keinsci.com/thread-33603-1-1.html

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yihanxu    时间: 2022-11-7 00:17
您好,请问在rocky linux 8上安装GMX和这个流程完全一样吗?http://sobereva.com/457
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牧生    时间: 2022-11-9 20:11
yihanxu 发表于 2022-11-7 00:17
您好,请问在rocky linux 8上安装GMX和这个流程完全一样吗?http://sobereva.com/457

流程是完全一样的。只不过需要使用新版
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yihanxu    时间: 2022-11-9 20:37
牧生 发表于 2022-11-9 20:11
流程是完全一样的。只不过需要使用新版

谢谢,已顺利安装rocky linux 8.6和gmx。有一点不同就是要自己安一下gfortran,以后安其他相关程序会用到。
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Sollovin    时间: 2022-12-2 11:14
系统自带的 GCC 套件不需要也不需要降级呀。额外再自己编译或安装一套低版本的 GCC 不就好了?
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knight1014    时间: 2023-5-24 22:55
yihanxu 发表于 2022-11-9 20:37
谢谢,已顺利安装rocky linux 8.6和gmx。有一点不同就是要自己安一下gfortran,以后安其他相关程序会用到 ...

请问如何安装gfortran? 我只会用yum install gfortran,在rocky 8.8中无法安装,请不吝赐教。knight1014@163.com
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WilliamH    时间: 2023-5-25 08:44
knight1014 发表于 2023-5-24 22:55
请问如何安装gfortran? 我只会用yum install gfortran,在rocky 8.8中无法安装,请不吝赐教。

https://installati.one/rockylinux/8/gcc-gfortran/
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hdhxx123    时间: 2023-5-25 12:45
本帖最后由 hdhxx123 于 2023-5-25 12:51 编辑

rocky linux9 安装gromacs 2018.8 没有问题啊,可能是cuda驱动导致旧版安装gromacs的GPU版不成功吧,纯CPU版没有问题。
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yihanxu    时间: 2023-6-14 21:56
knight1014 发表于 2023-5-24 22:55
请问如何安装gfortran? 我只会用yum install gfortran,在rocky 8.8中无法安装,请不吝赐教。

不好意思刚看到你的信息,你安装成功了吗?
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knight1014    时间: 2023-6-18 16:06
yihanxu 发表于 2023-6-14 21:56
不好意思刚看到你的信息,你安装成功了吗?

我最后又安装了rocky 9.1, gs, gv, orca能正常使用,就是不敢升级成9.2,不知什么原因,只要升级成9.2就启动不了,我的机子是epyc 7513。
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jim    时间: 2023-6-18 20:02
一不小心升级到9.2,全崩溃了,重装好久
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关于时间DE    时间: 2023-11-16 14:19
跑gmx_gpu,推荐什么系统和gmx版本呢




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