计算化学公社

标题: 求助，NAMD可以计算MM-PBSA吗 [打印本页]

作者
Author: qingqingdong 时间: 2022-9-28 18:31
标题: 求助，NAMD可以计算MM-PBSA吗
最近在研究蛋白质-配体相互作用，了解到可以计算结合自由能。其中MM-PBSA/GBSA应用比较广泛，也相对较为简单，想问一下在NAMD中可以计算MM-PBSA吗，没有找到这方面的资料，请大神指教

作者
Author: sobereva 时间: 2022-9-29 05:02
程序自身算不了

作者
Author: qingqingdong 时间: 2022-9-29 09:20

sobereva 发表于 2022-9-29 05:02
程序自身算不了

感谢回复，那有什么别的方案吗，还是只能换个软件计算

作者
Author: fhh2626 时间: 2022-9-29 12:05

qingqingdong 发表于 2022-9-29 09:20
感谢回复，那有什么别的方案吗，还是只能换个软件计算

要结合iapbs interface

https://mccammon.ucsd.edu/iapbs/

作者
Author: qingqingdong 时间: 2022-9-29 18:56

fhh2626 发表于 2022-9-29 12:05
要结合iapbs interface

https://mccammon.ucsd.edu/iapbs/

好的，感谢

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