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标题: 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 时出错 [打印本页]

作者
Author:
woshiblake    时间: 2022-9-29 14:24
标题: 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 时出错
本帖最后由 woshiblake 于 2022-9-29 14:24 编辑

使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索时,已用genmer成功产生了traj.xyz文件,然后用molclus结合gaussian做结构优化。就出现这样的错误:
Inputted trajectory file: traj.xyz
Loading basic information from the inputted trajectory file ...
There are totally        10 geometries in the inputted trajectory file

Setting file: settings.ini
Loading setting file ...
Program to be invoked: Gaussian
Task: Optimization
All frames in the inputted trajectory file will be processed

Cleaning old output and temporary files...
Deleting gauSP*
All Gaussian temporary files in current folder have been cleaned

Note: isomers.xyz already exists in current folder and "iappend" is set to 1, therefore new structures will be appended to this file

                         *** Configuration     1  ***
Current date: 2022-09-29   Time: 14:11:55
Loading geometry         1 from the inputted trajectory file
Generating gau.gjf...
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
molclus            0000000000426D63  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread-2.17.s  00002B9731474630  Unknown               Unknown  Unknown
molclus            0000000000416435  Unknown               Unknown  Unknown
molclus            000000000040B223  Unknown               Unknown  Unknown
molclus            0000000000404422  Unknown               Unknown  Unknown
libc-2.17.so       00002B97316A3555  __libc_start_main     Unknown  Unknown
molclus            0000000000404329  Unknown               Unknown  Unknown

我的genmer.ini和settings.ini设置见文本



作者
Author:
sobereva    时间: 2022-9-29 14:50
说明molclus的版本
从你的settings.ini上看似乎是猴年马月的版本
始终要用最新版,我也不提供老版本的答疑
settings.ini文件不要乱改,除了真正要改的地方不要乱改别的地方,哪怕是注释

作者
Author:
woshiblake    时间: 2022-9-29 15:11
sobereva 发表于 2022-9-29 14:50
说明molclus的版本
从你的settings.ini上看似乎是猴年马月的版本
始终要用最新版,我也不提供老版本的答 ...

谢谢,已解决,原因是我用您例子中提供的settings覆盖了新下载的settings,图方便惹麻烦
另外 再咨询下,有机金属配合物体系,优化用MMFF94关键词似乎报错?
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-9-29 15:20
woshiblake 发表于 2022-9-29 15:11
谢谢,已解决,原因是我用您例子中提供的settings覆盖了新下载的settings,图方便惹麻烦
另外 再咨询下, ...

MMFF94只适合有机分子




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