计算化学公社

标题: 求助：RMSF结果分析，曲线出现非正常变化 [打印本页]

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作者
Author: tongyu    时间: 2022-10-3 16:16
标题: 求助：RMSF结果分析，曲线出现非正常变化
利用Gromacs做MD，RMSF结果分析出现以下曲线（已标注），不明原因，请教大佬该结果是否正常。

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作者
Author: Frozen-Penguin    时间: 2022-10-3 17:53


这些部分输出的PDB文件里面没有，-s选的文件是不是也缺失这部分？

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作者
Author: sobereva    时间: 2022-10-4 09:33
看一下pdb文件里的残基号就知道了，明显残基号不是连续的

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作者
Author: tongyu    时间: 2022-10-4 14:28

Frozen-Penguin 发表于 2022-10-3 17:53
这些部分输出的PDB文件里面没有，-s选的文件是不是也缺失这部分？

好的谢谢我去查看下

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作者
Author: tongyu    时间: 2022-10-4 14:28

sobereva 发表于 2022-10-4 09:33
看一下pdb文件里的残基号就知道了，明显残基号不是连续的

谢谢sob老师

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