计算化学公社

标题: 关于msi2lmp将Ms转换成lammps需要的data文件 [打印本页]

作者
Author: keyanxiaobai 时间: 2022-10-3 22:15
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作者
Author: ZZU_SCU 时间: 2022-10-3 22:33
#号后的内容不会识别的，不用修改

作者
Author: keyanxiaobai 时间: 2022-10-3 23:24
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作者
Author: cyx98 时间: 2022-10-4 10:58
如果不区分石墨和三氟甲烷上的C，在MS里atom selection把C的forcefield type全部设置为c

作者
Author: keyanxiaobai 时间: 2022-10-9 22:26
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Author: cyx98 时间: 2022-10-10 10:20

keyanxiaobai 发表于 2022-10-9 22:26
反应力场是不是不能区别两种C的类型呀

不区分，就是看你后处理的时候需不需要区分。需要的话，用group命令

作者
Author: ZZU_SCU 时间: 2022-10-10 10:49

keyanxiaobai 发表于 2022-10-9 22:26
反应力场是不是不能区别两种C的类型呀

还是区分元素的好，结合dump_modify命令，在VMD可以被识别，后处理比较方便详见 http://bbs.keinsci.com/thread-29714-1-1.html

作者
Author: keyanxiaobai 时间: 2022-10-10 20:06
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Author: Deathaliveone 时间: 2022-10-29 13:50

keyanxiaobai 发表于 2022-10-10 20:06
如想通过虚拟机看看反应的运动轨迹需要区分元素吗

只要是C元素在同一个反应力场都是直接调用的，如果区分的话吗、，后处理可视化卡哇伊看到不同颜色的C，其他应该没影响。你喜欢的话可以手动都改成一种C

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