计算化学公社

标题: 使用Tachyon渲染的结果为什么改变颜色？ [打印本页]

作者
Author: sxwen 时间: 2022-10-8 10:53
标题: 使用Tachyon渲染的结果为什么改变颜色？
如图1是在OpenGL中显示的颜色，当我用Tachyon渲染以后，核酸有一部分从黄色变成了红色（图2）。请问出现这样的原因是什么？该如何解决呢？

作者
Author: 王二葛 时间: 2022-10-8 12:58
图 2 红色的这部分原子重复了，请检查坐标

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-8 19:26
因为两个rep都有这一段区域，而且二者显示方式相同而颜色不同，因此哪种颜色会实际显示出来有任意性

作者
Author: sxwen 时间: 2022-10-12 11:40

sobereva 发表于 2022-10-8 19:26
因为两个rep都有这一段区域，而且二者显示方式相同而颜色不同，因此哪种颜色会实际显示出来有任意性

谢谢老师，请问如何解决呢？因为黄色的部分是RNA，红色的部分是蛋白结构域，重叠的是蛋白的一个残基，不清楚为什么发生了这样的重叠，可以删除这个孤立的残基吗？

作者
Author: sxwen 时间: 2022-10-12 11:41

王二葛发表于 2022-10-8 12:58
图 2 红色的这部分原子重复了，请检查坐标

谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-12 12:36

sxwen 发表于 2022-10-12 11:40
谢谢老师，请问如何解决呢？因为黄色的部分是RNA，红色的部分是蛋白结构域，重叠的是蛋白的一个残基，不 ...

VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

看上文，反复调节选择区域，自然就能搞明白

作者
Author: sxwen 时间: 2022-10-12 16:45
好的，谢谢老师

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