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标题: 对于CDA分析和ETS-NOCV分析结果，与络合物稳定性是否有关？ [打印本页]

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Author: 护卫天使 时间: 2022-10-11 20:44
标题: 对于CDA分析和ETS-NOCV分析结果，与络合物稳定性是否有关？
老师们好，我想衡量三种络合物的稳定性，配体都一样，只是金属离子不同分别为Co、Ni、Cu，如.GJF文件。我计算了水合自由能，得到了稳定性的大小为:Cu配合物而>Ni配合物>Co配合物。我探究了CDA和ETS-NOCV分析，分别定义了三个片段：1五个水分子，2配体，3金属。1、对于CDA分析，片段2对三种金属（Co、Ni、Cu）的d-b分别为:0.056762，0.072341， 0.03999。其中d（2 donation 3）这一项中均出现了比较大的负值，分别为（只统计了大于0.01的值）：-0.015897，-0.013418，-0.025976。所以从片段轨道分析电荷转移，Cu配合物转移的少，是不是因为电子极化比较严重，导致电荷转移得比较少？是不是电荷转移多少与同类键的键强有一些联系？
2、对于ETS-NOCV分析，计算了三个片段总的轨道相互作用能分别为：-284.78，-256.01，-258.94。轨道相互作用包括电荷转移和电子极化，那么Co配合物相互作用能大的原因是因为电子极化比较大吗？而且发现配体和水也有弱相互作用，是不是我定义的片段方式对于轨道相互作用能产生了很大的影响？
3、对于上述的两个分析，该如何和稳定性扯上关联？希望能得到各位老师的指教！

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Author: sobereva 时间: 2022-10-12 13:20
“计算了水合自由能，得到了稳定性的大小”
不知道你怎么判断的稳定性

做CDA时基组不建议盲目过大，不是越大越好。def2-QZVP半弥散特征较强，结果可能还不如def2-TZVP。一般建议用def2-TZVP做CDA。

我就只看了一个结构cu.gjf，既然是在水环境下，羧基应当用质子解离的状态。当前结构就不甚合理

我不知道你做CDA、ETS-NOCV时是否带了溶剂模型，原则上来说做这样的分析，对整体和片段都应当在真空下计算波函数。即分析的只是真空下片段间的相互作用，溶剂化能对结合的影响应是额外单独考虑的，而且这本身也是可以在不同配合物之间对比来讨论的。

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Author: 护卫天使 时间: 2022-10-14 19:00

sobereva 发表于 2022-10-12 13:20
“计算了水合自由能，得到了稳定性的大小”
不知道你怎么判断的稳定性

感谢老师的答复。我做CDA、ETS-NOCV分析带上了溶剂模型，想着是为了统一计算方法。麻烦老师详细讲一下为什么不加会比加好一点？谢谢老师。

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Author: sobereva 时间: 2022-10-14 20:22

护卫天使发表于 2022-10-14 19:00
感谢老师的答复。我做CDA、ETS-NOCV分析带上了溶剂模型，想着是为了统一计算方法。麻烦老师详细讲一下为 ...

计算片段的时候，如果带了溶剂模型，本来应该挨着另一个片段的地方会感受到溶剂环境，导致被溶剂的反应场额外地极化，这和实际情况不符。除非计算片段的时候刻意把孔洞定义成和整体一致。

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