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标题: cp2k.popt进行并行时并行异常的问题 [打印本页]

作者
Author: 名字长的厉害 时间: 2022-10-12 16:23
标题: cp2k.popt进行并行时并行异常的问题
lz使用mpirun -np 16 cp2k.popt进行并行测试时，发现程序像是运行了16个副本，所有文本都输出16次。
但是当SCF收敛时，其他的进程会相应的终止，在一次迭代后16个进程还剩下4个
请问老师知道这是什么问题吗？是mpi的不兼容还是toolchain里的哪几个包没有装影响了并行？

另外lz使用cp2k.ssmp对这个脚本进行测试的时候是可以正常运行的，但是离子步只能占用一个线程，SCF时才能把cpu跑满，这是脚本的问题吗？
inp，xyz和显示输出的log见附件

作者
Author: Doria 时间: 2022-10-12 21:51
你运行了toolchain/install/setup了吗？

作者
Author: 名字长的厉害 时间: 2022-10-13 07:38

Doria 发表于 2022-10-12 21:51
你运行了toolchain/install/setup了吗？

运行了，我把source setup写进了bashrc

作者
Author: highlight 时间: 2022-10-13 08:57

发现程序像是运行了16个副本，所有文本都输出16次。

估计就是重现了这个问题 http://bbs.keinsci.com/thread-30322-1-1.html

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-13 13:15
通常是CP2K和MPI库编译问题，或者当前活动状态的MPI和实际编译CP2K用的MPI库不符，导致没并行成功

作者
Author: 名字长的厉害 时间: 2022-10-13 14:23

sobereva 发表于 2022-10-13 13:15
通常是CP2K和MPI库编译问题，或者当前活动状态的MPI和实际编译CP2K用的MPI库不符，导致没并行成功

应该是的，多谢sob老师，
我重新编译了一下，使用了toolchain自动安装的mpi而不是系统的mpi，离子步从五分钟左右缩短到大概10s
另外，看起来cp2k的离子步应该是纯mpi并行而不是openmp并行，所以ssmp效率低下

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