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标题: EDA-FF能否用NPA替换MK电荷 [打印本页]

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七尺贱    时间: 2022-10-14 19:14
标题: EDA-FF能否用NPA替换MK电荷
本帖最后由 七尺贱 于 2022-10-14 21:17 编辑

老师您好,我的体系是碳环与金属富勒烯的复合,在用EDF-FF进行能量分解时,发现静电相互作用非常小,占比几乎为0。用ADF对类似的体系进行过能量分解,如下图所示,色散一项(灰色)占据绝对的主导,但静电(绿色)一项的贡献也有20%左右,所以我将MK电荷替换为了NPA电荷,结果有了一定的改进,不知这种方法是否可行?

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sobereva    时间: 2022-10-14 20:01
不能用NPA,对静电势重现性很差,在《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml)的静电势对比里有充分的体现

本身碳环的原子电荷就全都为零,就算受到外环境影响而稍微被极化,也不可能静电相互作用能有多大。
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七尺贱    时间: 2022-10-14 21:23
sobereva 发表于 2022-10-14 20:01
不能用NPA,对静电势重现性很差,在《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/ ...

谢谢老师,我又上传了一张图,我在计算B碳环形成的复合物时,算出来的elec是正的,但是我计算了二者的电荷转移,B碳环向富勒烯转移的电荷数是多于A碳环的,这感觉解释不了,所以我换成了NPA电荷,结果和预期是一致的
Interaction energy components between all fragments:(from MK charge)
                         Electrostatic   Repulsion   Dispersion     Total
Frag   1 -- Frag   2:         0.12       223.38      -388.37      -164.87

Interaction energy components between all fragments:(from NPA charge)
                        Electrostatic   Repulsion   Dispersion     Total
Frag   1 -- Frag   2:       -17.95       245.26      -406.60      -179.29
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sobereva    时间: 2022-10-14 21:25
七尺贱 发表于 2022-10-14 21:23
谢谢老师,我又上传了一张图,我在计算B碳环形成的复合物时,算出来的elec是正的,但是我计算了二者的电 ...

我不知道你具体拿什么结构算的原子电荷
始终记住要拿单体的结构计算,不要用复合物的。EDA-FF也并不体现出微量电子转移对结合能的轻微影响
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七尺贱    时间: 2022-10-14 21:26
sobereva 发表于 2022-10-14 20:01
不能用NPA,对静电势重现性很差,在《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/ ...

就是我想表达的意思是静电相互作用很微弱,但是最起码是起积极贡献的,但是起到了负贡献有点不太正常了
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七尺贱    时间: 2022-10-14 21:32
sobereva 发表于 2022-10-14 21:25
我不知道你具体拿什么结构算的原子电荷
始终记住要拿单体的结构计算,不要用复合物的。EDA-FF也并不体现 ...

谢谢老师回复,我知道了
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sobereva    时间: 2022-10-14 21:50
七尺贱 发表于 2022-10-14 21:26
就是我想表达的意思是静电相互作用很微弱,但是最起码是起积极贡献的,但是起到了负贡献有点不太正常了

理解清楚原子电荷计算原理,以及基于原子电荷的静电相互作用计算公式
也要明白,理想的结合状态是让整体势能最小,并不意味着此时片段间静电相互作用一定是最强的。只有静电作用对结合有显著贡献的情况,静电相互作用能才理应算出来是负值




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