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标题: 出现Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误 [打印本页]

作者
Author: hellockh 时间: 2016-5-18 00:45
标题: 出现Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误

在做scan的时候算到18步就一直出现Error termination in NtrErr:NtrErr Called from FileIO. 错误，提取结构再算也不行，在网上查了，说可能是磁盘空间不足，然后把scratch里边的东西删掉了也不行，出错的部分如下：
Rotational constants (GHZ):    0.2228569    0.1970274    0.1272952
Standard basis: 6-31+G(d) (6D, 7F)
There are 494 symmetry adapted cartesian basis functions of A symmetry.
There are 494 symmetry adapted basis functions of A symmetry.
494 basis functions, 844 primitive gaussians, 494 cartesian basis functions
85 alpha electrons    85 beta electrons
   nuclear repulsion energy    1897.0962147266 Hartrees.
NAtoms= 43 NActive= 43 NUniq= 43 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 NAOKFM=F Big=F
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 494 RedAO= T EigKep=  1.13D-06  NBF= 494
NBsUse= 493 1.00D-06 EigRej=  9.15D-08 NBFU= 493
Lowest energy guess from the checkpoint file:  "rawC-scan-1.chk"
B after Tr=    0.000000 0.000000 0.000000
      Rot= 0.998896 0.008834 0.003058 -0.046031 Ang= 5.38 deg.
B after Tr=    0.000000 0.000000 0.000000
      Rot= 0.951332 -0.053592 -0.031752 0.301806 Ang= -35.90 deg.
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 1 IFilNo(1)=  -526 Len=    243542 IPos=          0 Q= 46912509846856

dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 83 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd = 27250176 FType=2 FMxFil=10000

Number             0          0          0          0          0          0
Base       12418969    12426240    10589696    10218496    12293632    10341376
End       12419072    12541440    10706944    10219008    12296704    10345472
End1       12419072    12541440    10706944    10219008    12296704    10345472
Wr Pntr    12418969    12424963    10589184    10218496    12293632    10341376
Rd Pntr    12418969    12424963    10589184    10218496    12293632    10341376
Length          103       115200       117248          512       3072       4096

Number             0          0          0          0          0          0
Base       8604160       182784    9827840    12420096    13402112    23677706
End          8605184       183808    9828352    12425216    23429584    27250176
End1       8605184       183808    9828352    12425216    23429584    27250176
Wr Pntr    8604160       182784    9827840    12422144    13645654    23677706
Rd Pntr    8604160       182784    9827840    12422144    13444102    23677706
Length          1024       1024          512       5120    10027472    3572470

Number          501          502          503          505          508          511
Base          43520    8588288       180224       335872    8605184       282624
End          44520    8593134       180612       456872    8605214       308051
End1          44544    8593408       180736       457216    8605696       308224
Wr Pntr       43520    8588288       180224       335872    8605184       282624
Rd Pntr       43520    8588288       180224       335872    8605184       282624
Length          1000       4846          388       121000          30       25427

Number          514          515          516          517          518          520
Base       9462272    8972800    8605696    10195968    9828864    8603648
End          9584537    9461860    8972491    10217210    10195659    8603658
End1       9584640    9462272    8972800    10217472    10195968    8604160
Wr Pntr    9462272    8972800    8605696    10195968    9828864    8603648
Rd Pntr    9584537    8972800    8605696    10195968    9828864    8603648
Length       122265       489060       366795       21242       366795          10

Number          521          522          523          524          526          528
Base       8584192    12425216    10217472    10345984    9584640    10706944
End          8584227    12425709    10218458    10589526    9827688    10829209
End1       8584704    12425728    10218496    10589696    9827840    10829312
Wr Pntr    8584192    12425708    10217472    10589526    9584640    10706944
Rd Pntr    8584192    12425216    10217472    10589526    9584640    10706944
Length          35          493          986       243542       243048       122265

Number          530          532          534          536          538          550
Base       10219008    10829312    11195392    11317760    11440128       308224
End       10341273    10951577    11317657    11440025    11562393       335451
End1       10341376    10951680    11317760    11440128    11562496       335872
Wr Pntr    10219008    10829312    11195392    11440025    11562393       308224
Rd Pntr    10219008    10829312    11195392    11317760    11440128       308224
Length       122265       122265       122265       122265       122265       27227

Number          551          552          559          561          562          563
Base       8582144    8581120       74752    8582656    8574464    10345472
End          8582182    8581156       74754    8582657    8580985    10345966
End1       8582656    8581632       75264    8583168    8581120    10345984
Wr Pntr    8582144    8581120       74752    8582656    8574464    10345472
Rd Pntr    8582182    8581120       74752    8582656    8580985    10345472
Length          38          36          2          1       6521          494

Number          565          571          575          577          579          580
Base          76288    12296704       185344       75776    8581632       72192
End          76446    12418969       282425       75828    8581675       73180
End1          76800    12418969       282624       76288    8582144       73216
Wr Pntr       76288    12296704       185344       75776    8581632       72192
Rd Pntr       76288    12296704       185344       75828    8581632       72192
Length          158       122265       97081          52          43          988

Number          581          582          583          584          598          603
Base          73216    8593408       75264    8594944       76800    12419072
End          74276    8594890       75308    8595202       76802    12419073
End1          74752    8594944       75776    8595456       77312    12419584
Wr Pntr       73216    8593408       75264    8594944       76800    12419072
Rd Pntr       73216    8593408       75264    8594944       76800    12419072
Length          1060       1482          44          258          2          1

Number          605          606          619          634          665          670
Base       12419584    12425728    8595456    23429584       180736    8584704
End       12419585    12426221    8601701    23677706       182756    8587930
End1       12420096    12426240    8602112    23677706       182784    8588288
Wr Pntr    12419584    12426221    8595456    23429584       180736    8584704
Rd Pntr    12419584    12425728    8595456    23429584       180736    8587930
Length             1          493       6245       248122       2020       3226

Number          672          674          685          695          698          701
Base          41984       183808    10951680    8602112    8583680       457216
End          42347       184227    11195222    8603473    8583938    8574025
End1          42496       184320    11195392    8603648    8584192    8574464
Wr Pntr       41984       183808    10951680    8602112    8583680       457216
Rd Pntr       41984       183808    11195222    8602112    8583680       457216
Length          363          419       243542       1361          258    8116809

Number          729          742          761          783          989          991
Base       11562496    9828352    8583168    12541440       44544       65536
End       12293122    9828384    8583169    12670816       64544       72098
End1       12293632    9828864    8583680    12670976       65024       72192
Wr Pntr    11562496    9828352    8583168    12541440       44544       65536
Rd Pntr    11562496    9828352    8583168    12541440       44544       72098
Length       730626          32          1       129376       20000       6562

Number          992          993          994          995          996          997
Base          65024       43008       40448       42496       41472       184320
End          65033       43208       40478       42516       41672       185168
End1          65536       43520       40960       43008       41984       185344
Wr Pntr       65024       43008       40448       42496       41472       184320
Rd Pntr       65033       43208       40478       42516       41672       185168
Length             9          200          30          20          200          848

Number          998          999       2551       2556       9999
Base          40960       77312    12670976    12914688    13158400
End          41160       179816    12914518    13158230    13401942
End1          41472       180224    12914688    13158400    13402112
Wr Pntr       40960       77312    12914518    13158230    13401942
Rd Pntr       41160       79816    12914518    13158230    13401942
Length          200       102504       243542       243542       243542

dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles = 52 SizExt =       0 WInBlk =    512
               defal = F LstWrd = 10321920 FType=2 FMxFil=10000

Number             0          0          0          0          501          502
Base          289786    1304868    1312101    10321822       534812       535812
End          290282    1305856    1434411    10321920       535812       540658
End1          290282    1305856    1434411    10321920       535812       540658
Wr Pntr       289786    1304868    1312101    10321822       534812       535812
Rd Pntr       289786    1304868    1312101    10321822       534812       535812
Length          496          988       122310          98       1000       4846

Number          503          505          508          511          520          521
Base       1435193       600572       40448       543884       721572       818737
End          1435581       721572       40478       569311       721582       818772
End1       1435581       721572       40478       569311       721582       818772
Wr Pntr    1435193       600572       40448       543884       721572       818737
Rd Pntr    1435193       600572       40448       543884       721572       818737
Length          388       121000          30       25427          10          35

Number          522          524          526          528          530          532
Base          40678       818772    1061820    9553679    9675944    9798209
End          41662    1061820    1304868    9675944    9798209    9920474
End1          41662    1061820    1304868    9675944    9798209    9920474
Wr Pntr       40678       818772    1061820    9553679    9675944    9798209
Rd Pntr       41662       818772    1061820    9553679    9675944    9798209
Length          984       243048       243048       122265       122265       122265

Number          534          536          538          550          551          552
Base       9920474       290282       412547    10042739       721618       721582
End       10042739       412547       534812    10069966       721656       721618
End1       10042739       412547       534812    10069966       721656       721618
Wr Pntr    9920474       290282       412547    10042739       721618       721582
Rd Pntr    9920474       412547       534812    10042739       721618       721582
Length       122265       122265       122265       27227          38          36

Number          561          562          563          565          575          577
Base          593998       593999    10069966    10070460       721656       600520
End          593999       600520    10070460    10070618       818737       600572
End1          593999       600520    10070460    10070618       818737       600572
Wr Pntr       593998       593999    10069966    10070460       721656       600520
Rd Pntr       593998       593999    10069966    10070460       721656       600520
Length             1       6521          494          158       97081          52

Number          579          580          581          582          583          584
Base       9552648    9552691    10070618    10071678    10073160       571331
End          9552691    9553679    10071678    10073160    10073204       571589
End1       9552691    9553679    10071678    10073160    10073204       571589
Wr Pntr    9552648    9552691    10070618    10071678    10073160       571331
Rd Pntr    9552648    9552691    10070618    10071678    10073160       571331
Length          43          988       1060       1482          44          258

Number          603          605          619          634          665          670
Base          289785       289784    1305856       41662       569311       540658
End          289786       289785    1312101       289784       571331       543884
End1          289786       289785    1312101       289784       571331       543884
Wr Pntr       289785       289784    1305856       41662       569311       540658
Rd Pntr       289785       289784    1305856       289784       569311       543884
Length             1          1       6245       248122       2020       3226

Number          672          674          695          698          701          780
Base       1434411    1434774       571589    1435581    1435839    10073204
End          1434774    1435193       572950    1435839    9552648    10321822
End1       1434774    1435193       572950    1435839    9552648    10321822
Wr Pntr    1434411    1434774       571589    1435581    1435839    10073204
Rd Pntr    1434411    1434774       571589    1435581    1435839    10321822
Length          363          419       1361          258    8116809       248618

Number          989          993          997          998
Base          572950       592950       593150       40478
End          592950       593150       593998       40678
End1          592950       593150       593998       40678
Wr Pntr       572950       592950       593150       40478
Rd Pntr       572950       592950       593150       40678
Length       20000          200          848          200

dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    65536 FType=2 FMxFil=10000

Number             0
Base          40448
End          65536
End1          65536
Wr Pntr       40448
Rd Pntr       40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

输入文件的开头如下：
%chk=rawC-scan-1.chk
%mem=16GB
%nprocshared=16
# opt=modredundant b3lyp/6-31+g(d) MaxDisk=60GB geom=connectivity

没有加MaxDisk=60GB 的也试过，都不行
之前计算的时候也出现过这样的错误，然后再接着算就没问题了，感觉是稀里糊涂的就好了，这次试了很多方法都不好，希望大家不吝赐教，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-5-18 10:34
如果用的是高斯老版本，换成D.01再试。主要是bug所致。

maxdisk和这个没关系，而且DFT优化本身就不怎么耗硬盘。

作者
Author: hellockh 时间: 2016-5-18 11:15

sobereva 发表于 2016-5-18 10:34
如果用的是高斯老版本，换成D.01再试。主要是bug所致。

maxdisk和这个没关系，而且DFT优化本身就不怎么 ...

老师您好，我用的就是D.01的版本

作者
Author: hellockh 时间: 2016-5-18 11:19

sobereva 发表于 2016-5-18 10:34
如果用的是高斯老版本，换成D.01再试。主要是bug所致。

maxdisk和这个没关系，而且DFT优化本身就不怎么 ...

这样还有什么办法可以继续计算吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-5-18 12:46
续算够呛
总共扫多少步？如果只剩几个点了，索性自己用限制性优化来完成。

作者
Author: hellockh 时间: 2016-5-18 13:35

sobereva 发表于 2016-5-18 12:46
续算够呛
总共扫多少步？如果只剩几个点了，索性自己用限制性优化来完成。

总共有100步，才走了18步。。。
限制性优化是加什么关键字啊？tight吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-5-18 21:06

hellockh 发表于 2016-5-18 13:35
总共有100步，才走了18步。。。
限制性优化是加什么关键字啊？tight吗？

tight设的是收敛限，和限制性优化有什么关系
opt=modredundant，看手册里opt当中的介绍，用F来冻结变量。

作者
Author: hellockh 时间: 2016-5-19 12:42

sobereva 发表于 2016-5-18 21:06
tight设的是收敛限，和限制性优化有什么关系
opt=modredundant，看手册里opt当中的介绍，用F来冻结变 ...

好的，谢谢老师~

作者
Author: whtu 时间: 2016-7-6 09:44
本帖最后由 whtu 于 2016-7-6 09:46 编辑

sobereva 发表于 2016-5-18 21:06
tight设的是收敛限，和限制性优化有什么关系
opt=modredundant，看手册里opt当中的介绍，用F来冻结变 ...

老师，我也遇到同样的问题。
我先进行气相优化，能够收敛无虚频，输入文件如下：
%chk=cation049.chk
%nprocshared=24
%mem=60GB
# opt freq b3lyp/6-311+g(d)

cation

1 1
C                -2.52763956 1.81025405 -1.74408172
C                -1.13490024 1.95969013 -1.70086124
C                -0.57152816 3.23199868 -1.53423351
C                -1.40089539 4.35487114 -1.41082612
C                -2.79363476 4.20543470 -1.45404368
C                -3.35700683 2.93312627 -1.62067237
C                -0.22350767 0.72576411 -1.83647164
N                0.04196103 0.16388908 -0.50428440
C                0.09518442 0.92155740 0.75090662
C                0.36222680 0.03761646 1.72914548
N                0.47792743 -1.27920779 1.09276061
C                0.27725729 -1.13251331 -0.22992863
C                0.31152077 -2.27018901 -1.26729068
C                0.76458869 -2.54494311 1.78315134
C                2.28735665 -2.76930510 1.83254126
C                2.58766855 -4.09531346 2.55580779
H                2.74985641 -1.96205226 2.36106449
H                -0.05049365 1.97530949 0.86616478
H                0.46966427 0.25354007 2.77161092
H                0.37771956 -2.50311997 2.77988757
H                0.30208897 -3.35219591 1.25462803
H                2.67422571 -2.81112830 0.83580502
H                -0.70756255 -0.01013853 -2.44395677
H                0.70055520 1.01331242 -2.29289662
H                0.64026269 -1.88399224 -2.20945883
H                0.98712386 -3.03214147 -0.93882616
H                -0.66901776 -2.68489629 -1.37435160
H                -2.95778669 0.83881798 -1.87130371
H                -4.42039426 2.81902816 -1.65366931
H                -3.42687513 5.06277226 -1.35981548
H                -0.97074828 5.32630713 -1.28360364
H                0.49185921 3.34609646 -1.50123385
C                4.11043650 -4.31967552 2.60519754
H                2.20079959 -4.05349021 3.55254406
H                2.12516870 -4.90256627 2.02728461
H                4.31909481 -5.24099303 3.10772689
H                4.49730544 -4.36149876 1.60846125
H                4.57293634 -3.51242269 3.13372070

然后就读取优化后的构型，进行cosmo模型下的优化，想生成cosmo文件，输入文件如下：

%nprocshared=24
%mem=60GB
%chk=cation049
#p opt b3lyp/6-311+g(d) int=ultrafine geom=allcheck guess=read scrf=cosmo

--Link1--
%chk=cation049
#p b3lyp/6-311+g(d) int=ultrafine geom=allcheck guess=read scrf=cosmors

cation049.cosmo

到这一步就出现了像楼主这样的提示错误：
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 1 IFilNo(1)=  -526 Len=    190969 IPos=          0 Q= 47116836275528

dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 88 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd = 24407040 FType=2 FMxFil=10000

Number             0          0          0          0          0          0
Base       7460235    16588569    9679872    9118720    9406976       370688
End          7460352    16588800    9693184    9119744    9411072       371712
End1       7460352    16588800    9693184    9119744    9411072       371712
Wr Pntr    7460235    16588569    9678848    9118720    9406976       370688
Rd Pntr    7460235    16588569    9678848    9118720    9406976       370688
Length          117          231       13312       1024       4096       1024

Number             0          0          0          0          0          0
Base          182784       75264    9411584    10443643    7651328    9414656
End          183296       76800    9413632    10452992    7665152    9677312
End1          183296       76800    9413632    10452992    7665152    9677312
Wr Pntr       182784       75264    9411584    10443643    7651328    9674240
Rd Pntr       182784       75264    9411584    10443643    7651328    9674240
Length          512       1536       2048       9349       13824       262656

Number             0          0          0          0          501          502
Base       8431104    10941952    1139200    23764480       43520       356352
End          8622080    16492866    7264868    24407040       44520       361112
End1       8622080    16492866    7264868    24407040       44544       361472
Wr Pntr    8431104    11132921    1330169    23764480       43520       356352
Rd Pntr    8431104    10969046    1166294    23764480       43520       356352
Length       190976    5550914    6125668       642560       1000       4760

Number          503          508          511          514          515          516
Base          180224       371712       269312    8335360    7952384    7665152
End          180567       371742       290224    8431063    8335196    7952261
End1          180736       372224       290304    8431104    8335360    7952384
Wr Pntr       180224       371712       269312    8335360    7952384    7665152
Rd Pntr       180224       371712       269312    8431063    7952384    7665152
Length          343          30       20912       95703       382812       287109

Number          517          518          520          521          522          523
Base       8909824    8622592       370176       352256    9678848    8926720
End          8926430    8909701       370186       352291    9679285    8927594
End1       8926720    8909824       370688       352768    9679360    8927744
Wr Pntr    8909824    8622592       370176       352256    9679284    8926720
Rd Pntr    8909824    8622592       370176       352256    9678848    8926720
Length       16606       287109          10          35          437          874

Number          524          526          528          530          532          534
Base       10560000    8927744    9693184    9311232    9788928    9884672
End       10750969    9118276    9788887    9406935    9884631    9980375
End1       10750976    9118720    9788928    9406976    9884672    9980416
Wr Pntr    10750969    8927744    9693184    9311232    9788928    9884672
Rd Pntr    10750969    8927744    9693184    9311232    9788928    9884672
Length       190969       190532       95703       95703       95703       95703

Number          536          538          551          552          559          561
Base       9119744    9215488       183808       349696       74240       350720
End          9215447    9311191       183846       349728       74242       350721
End1       9215488    9311232       184320       350208       74752       351232
Wr Pntr    9215447    9311191       183808       349696       74240       350720
Rd Pntr    9119744    9215488       183846       349696       74240       350720
Length       95703       95703          38          32          2          1

Number          562          563          565          571          575          577
Base          343040    9411072       361984    16492866       185344       361472
End          349506    9411509       362149    16588569       269045       361524
End1          349696    9411584       362496    16588569       269312       361984
Wr Pntr       343040    9411072       361984    16492866       185344       361472
Rd Pntr       349506    9411072       361984    16492866       185344       361524
Length          6466          437          165       95703       83701          52

Number          579          580          581          582          583          584
Base          350208       72192       73216    9677312       74752       362496
End          350246       73083       74179    9678623       74791       362724
End1          350720       73216       74240    9678848       75264       363008
Wr Pntr       350208       72192       73216    9677312       74752       362496
Rd Pntr       350208       72192       73216    9677312       74752       362496
Length          38          891          963       1311          39          228

Number          598          603          605          606          619          634
Base          76800    9413632    9414144    9679360       363008    7264868
End          76802    9413633    9414145    9679797       368533    7460235
End1          77312    9414144    9414656    9679872       368640    7460235
Wr Pntr       76800    9413632    9414144    9679797       363008    7264868
Rd Pntr       76800    9413632    9414144    9679360       363008    7264868
Length             2          1          1          437       5525       195367

Number          665          670          672          674          685          695
Base          180736       352768       41984       183296    7460352       368640
End          182567       355957       42347       183670    7651321       369846
End1          182784       356352       42496       183808    7651328       370176
Wr Pntr       180736       352768       41984       183296    7460352       368640
Rd Pntr       180736       355957       41984       183296    7651321       368640
Length          1831       3189          363          374       190969       1206

Number          698          701          710          711          729          742
Base          351744       290304       372224    10171392       375296    8622080
End          351972       342753       375291    10443643       947766    8622112
End1          352256       343040       375296    10443643       948224    8622592
Wr Pntr       351744       290304       372224    10171392       375296    8622080
Rd Pntr       351744       290304       372224    10171392       375296    8622080
Length          228       52449       3067       272251       572470          32

Number          755          761          783          989          991          992
Base       16588800       351232    10452992       44544       65536       65024
End       23764007       351233    10559583       64544       72098       65033
End1       23764480       351744    10560000       65024       72192       65536
Wr Pntr    16588800       351232    10452992       44544       65536       65024
Rd Pntr    16588800       351232    10452992       44544       72098       65033
Length       7175207          1       106591       20000       6562          9

Number          993          994          995          996          997          998
Base          43008       40448       42496       41472       184320       40960
End          43208       40478       42516       41672       185078       41160
End1          43520       40960       43008       41984       185344       41472
Wr Pntr       43008       40448       42496       41472       184320       40960
Rd Pntr       43208       40478       42516       41672       185078       41160
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Number          999       2551       2556       9999
Base          77312    9980416    10750976       948224
End          179816    10171385    10941945    1139193
End1          180224    10171392    10941952    1139200
Wr Pntr       77312    10171385    10941945    1139193
Rd Pntr       79816    10171385    10941945    1139193
Length       102504       190969       190969       190969

dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles = 62 SizExt =       0 WInBlk = 131072
               defal = F LstWrd =    2490368 FType=2 FMxFil=10000

Number             0          0          0          0          0          0
Base       1051272       327782    1495425    1057868    1102271    2055483
End          1051311       327982    1587426    1102243    1147013    2152568
End1       1051311       327982    1587426    1102243    1147013    2152568
Wr Pntr    1051272       327782    1495425    1057868    1102271    2055483
Rd Pntr    1051272       327782    1495425    1057868    1102271    2055483
Length          39          200       92001       44375       44742       97085

Number             0          0          0          0          501          502
Base          131302    1343688    1044871    2439677       519388       520388
End          132176    1344127    1045745    2490368       520388       525148
End1          132176    1344127    1045745    2490368       520388       525148
Wr Pntr       131302    1343688    1044871    2439677       519388       520388
Rd Pntr       131302    1343688    1044871    2439677       519388       520388
Length          874          439          874       50691       1000       4760

Number          503          508          511          520          521          522
Base       1147750       131072       528337       579991       663772    1494553
End          1148093       131102       549249       580001       663807    1495425
End1       1148093       131102       549249       580001       663807    1495425
Wr Pntr    1147750       131072       528337       579991       663772    1494553
Rd Pntr    1147750       131072       528337       579991       663772    1495425
Length          343          30       20912          10          35          872

Number          524          526          528          530          532          534
Base          663807       854339    1396576    2152568    2248271    2343974
End          854339    1044871    1492279    2248271    2343974    2439677
End1          854339    1044871    1492279    2248271    2343974    2439677
Wr Pntr       663807       854339    1396576    2152568    2248271    2343974
Rd Pntr       663807       854339    1396576    2152568    2248271    2343974
Length       190532       190532       95703       95703       95703       95703

Number          536          538          545          548          551          552
Base          327982       423685    1102243       132176       580033       580001
End          423685       519388    1102271       323145       580071       580033
End1          423685       519388    1102271       323145       580071       580033
Wr Pntr       327982       423685    1102243       132176       580033       580001
Rd Pntr       423685       519388    1102243       132176       580033       580001
Length       95703       95703          28       190969          38          32

Number          561          562          563          565          569          575
Base          573472       573473       327141       327578    1057866       580071
End          573473       579939       327578       327743    1057868       663772
End1          573473       579939       327578       327743    1057868       663772
Wr Pntr       573472       573473       327141       327578    1057866       580071
Rd Pntr       573472       573473       327141       327578    1057866       580071
Length             1       6466          437          165          2       83701

Number          577          579          580          581          582          583
Base          579939       326212       326250    1492279    1493242       327743
End          579991       326250       327141    1493242    1494553       327782
End1          579991       326250       327141    1493242    1494553       327782
Wr Pntr       579939       326212       326250    1492279    1493242       327743
Rd Pntr       579939       326212       326250    1492279    1493242       327743
Length          52          38          891          963       1311          39

Number          584          585          603          605          619          634
Base          551080    1051311    1051271    1051270    1045745    1148321
End          551308    1057866    1051272    1051271    1051270    1343688
End1          551308    1057866    1051272    1051271    1051270    1343688
Wr Pntr       551080    1051311    1051271    1051270    1045745    1148321
Rd Pntr       551080    1051311    1051271    1051270    1045745    1343688
Length          228       6555          1          1       5525       195367

Number          665          670          672          674          695          698
Base          549249       525148    1147013    1147376       551308    1148093
End          551080       528337    1147376    1147750       552514    1148321
End1          551080       528337    1147376    1147750       552514    1148321
Wr Pntr       549249       525148    1147013    1147376       551308    1148093
Rd Pntr       549249       528337    1147013    1147376       551308    1148093
Length          1831       3189          363          374       1206          228

Number          701          710          711          780          989          993
Base       1344127       323145    1783232    1587426       552514       572514
End          1396576       326212    2055483    1783232       572514       572714
End1       1396576       326212    2055483    1783232       572514       572714
Wr Pntr    1344127       323145    1783232    1587426       552514       572514
Rd Pntr    1344127       323145    1783232    1783232       552514       572514
Length       52449       3067       272251       195806       20000          200

Number          997          998
Base          572714       131102
End          573472       131302
End1          573472       131302
Wr Pntr       572714       131102
Rd Pntr       572714       131302
Length          758          200

dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    65536 FType=2 FMxFil=10000

Number             0
Base          40448
End          65536
End1          65536
Wr Pntr       40448
Rd Pntr       40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

在网上查了下，说有可能是读取chk文件有问题，于是我将第一步优化的构型取出放到输入文件，如下：
%chk=cation049.chk
%nprocshared=24
%mem=60GB
#p opt freq b3lyp/6-311+g(d) int=ultrafine scrf=cosmo

cation

1 1
C                -4.46402375 1.40234947 0.00000000
C                -3.73981875 1.14038847 1.16855000
C                -4.24912075 0.23178647 2.10205900
C                -5.46172675 -0.41349753 1.86674100
C                -6.17357775 -0.15322453 0.69702500
C                -5.67486975 0.75637347 -0.23546200
C                -2.43041175 1.83833847 1.42506000
N                -1.26508875 1.14760847 0.78897300
C                -1.27519775 -0.10216453 0.19877800
C                -0.01255475 -0.34564653 -0.23509400
N                0.75701125 0.75709347 0.09075000
C                -0.01939875 1.65786447 0.72193500
C                0.39096025 2.99059847 1.23971100
C                2.20700425 0.86918047 -0.18248600
C                3.07149325 0.31530147 0.95228400
C                4.56744325 0.40983547 0.62623300
H                2.79664625 -0.72865253 1.13987000
H                -2.17238275 -0.69243953 0.13446900
H                0.40178225 -1.19607453 -0.75019900
H                2.38584825 0.32763547 -1.11281500
H                2.43090025 1.91723447 -0.38433400
H                2.85773125 0.86169447 1.87844800
H                -2.44788175 2.85545947 1.03062900
H                -2.22509775 1.89500347 2.49605300
H                -0.01779275 3.16381747 2.23705000
H                1.47381625 3.07285647 1.30773400
H                0.03197425 3.79453447 0.58932200
H                -4.08912975 2.11989247 -0.72456500
H                -6.23381675 0.97037647 -1.13976400
H                -7.12042875 -0.65023653 0.51643200
H                -5.85346475 -1.10992053 2.59985800
H                -3.70564975 0.03426347 3.02179300
C                5.44985525 -0.13988053 1.74882800
H                4.77300925 -0.13646653 -0.30182200
H                4.83401425 1.45503447 0.42861800
H                6.50717925 -0.06153653 1.48762700
H                5.30086925 0.40947047 2.68296000
H                5.23737825 -1.19454153 1.94573100

这样还是出现一样的错误，不知道怎么解决了。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-7-6 09:52
用#p opt freq b3lyp/6-311g(d) scrf=cosmo再算
弥散毫无意义，白费时间，增加资源和时间消耗
int=ultrafine对当前根本用不着

作者
Author: whtu 时间: 2016-7-7 19:33
本帖最后由 whtu 于 2016-7-7 19:55 编辑

sobereva 发表于 2016-7-6 09:52
用#p opt freq b3lyp/6-311g(d) scrf=cosmo再算
弥散毫无意义，白费时间，增加资源和时间消耗
int=ultraf ...

好的，谢谢sob老师。我还想问一下:弥散用不着是因为用了cosmo溶剂化模型还是因为这个体系是阳离子？对于当前int=utrafine用不着是因为b3lyp对格点的依赖不强还是因为用了cosmo溶剂化模型？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-7-8 05:31

whtu 发表于 2016-7-7 19:33
好的，谢谢sob老师。我还想问一下:弥散用不着是因为用了cosmo溶剂化模型还是因为这个体系是阳离子？对于 ...

都跟COSMO无关
meta系列泛函为了得到更精准结果才有必要用ultrafine，B3LYP这样普通泛函没特殊情况时无需加这个。
不需要加弥散的时候一律不要加，否则自讨苦吃，更何况还是阳离子，用弥散毫无意义。

作者
Author: whtu 时间: 2016-7-8 09:40

sobereva 发表于 2016-7-8 05:31
都跟COSMO无关
meta系列泛函为了得到更精准结果才有必要用ultrafine，B3LYP这样普通泛函没特殊情况时 ...

谢谢sob老师解答。sob老师，我研究的是离子液体的构效关系、热力学，涉及到多种阳离子和阴离子，对弥散函数的选取很模糊，看论坛的帖子中有说阴离子不妨加弥散，特别是考虑弱相互作用的时候，而我考虑到部分离子液体阴阳离子间存在氢键以及离子液体与极性分子存在氢键，于是我在气相的结构优化和生成cosmo文件都时都加了弥散函数。所以我想问一下，是否添加弥散函数对生成cosmo文件大不大？或者对于阳离子统一去掉弥散函数而阴离子添加弥散函数，但是这样的话阴阳离子就不在一个计算水平了，对于生成cosmo文件这样合理吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-7-8 13:36

whtu 发表于 2016-7-8 09:40
谢谢sob老师解答。sob老师，我研究的是离子液体的构效关系、热力学，涉及到多种阳离子和阴离子，对弥散函 ...

你生成COSMO文件的目的是什么？之后用于COSMO-RS计算？
阴离子应该加弥散，中性、阳离子都不要加弥散。
阳离子不加弥散阴离子加弥散，这绝对不叫不在一个计算水平。那些专门做溶剂模型的人，也是只对阴离子才加弥散。

作者
Author: whtu 时间: 2016-7-8 14:16

sobereva 发表于 2016-7-8 13:36
你生成COSMO文件的目的是什么？之后用于COSMO-RS计算？
阴离子应该加弥散，中性、阳离子都不要加弥散。
...

谢谢sob老师。我生成cosmo文件就是要用于COSMO-RS的计算，照老师这么说，阳离子也就没必要加弥散了。另外，同一计算水平不应该是方法和基组一致吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-7-8 16:44

whtu 发表于 2016-7-8 14:16
谢谢sob老师。我生成cosmo文件就是要用于COSMO-RS的计算，照老师这么说，阳离子也就没必要加弥散了。另外 ...

不要非得刻意追求用所谓的同一计算水平，这是极为狭隘的
正确理解是：让计算的体系都能达到相同的精度
阳离子加不加弥散结果都差不多，而阴离子不加弥散结果可能不合理，所以阳离子不加弥散和阴离子加弥散是同一精度水平的

作者
Author: 三石草祭 时间: 2016-7-19 15:35
您好，我想问一下你这个问题解决了吗？我也遇到了同样的续算问题

作者
Author: hellockh 时间: 2016-7-19 15:58

三石草祭发表于 2016-7-19 15:35
您好，我想问一下你这个问题解决了吗？我也遇到了同样的续算问题

我换了一个基组就解决了，这个应该是高斯本身的一个bug

作者
Author: 三石草祭 时间: 2016-7-22 09:54

hellockh 发表于 2016-7-19 15:58
我换了一个基组就解决了，这个应该是高斯本身的一个bug

谢谢老师，我试试看

作者
Author: 小龙斯坦 时间: 2016-9-7 08:16
我在单点计算的时候也遇到了同样的报错，关键字如下：
#p CCSD(T)(full)/def2QZVPP scf=conver=6
体系中共有7个原子，其中两个是第4周期碱土金属原子，如果不加full，就会出现“Excessive_mixing_of_frozen_core_and_valence_orbitals.”这样的报错，所以加了full。
现在出现Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.报错，请问该怎样解决

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-7 12:35

小龙斯坦发表于 2016-9-7 08:16
我在单点计算的时候也遇到了同样的报错，关键字如下：
#p CCSD(T)(full)/def2QZVPP scf=conver=6
体系中 ...

原因可能有多种，诸如硬盘不够
也可尝试#p CCSD(T,full)/cc-pVQZ。硬盘空间若不够应腾出一些，或用maxdisk指定还剩多少。
不要用conver=6

作者
Author: 小龙斯坦 时间: 2016-9-7 17:22

sobereva 发表于 2016-9-7 12:35
原因可能有多种，诸如硬盘不够
也可尝试#p CCSD(T,full)/cc-pVQZ。硬盘空间若不够应腾出一些，或用maxdi ...

降低了计算精度：
用#p CCSD(T)(full)/def2TZVPP scf=conver=6在计算，应该可以出结果；
我们在计算单点能的时候不是可以用conver=6么

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-7 23:45

小龙斯坦发表于 2016-9-7 17:22
降低了计算精度：
用#p CCSD(T)(full)/def2TZVPP scf=conver=6在计算，应该可以出结果；
我们在计算单 ...

当前是用高精度方法计算，显然就不应该再把收敛精度降低，何况后HF计算依赖于HF轨道，比起DFT算单点对收敛精度要求更高。
而且，默认标准下也不是收敛不了，体系又不大，降到6也毫无意义。

作者
Author: ztl1978 时间: 2016-9-24 20:07
sob老师您好，我看别人的内存设置达到60G，我想请教一下，是不是只有LINUX版本的高斯才可以设置这么大的内存，当然内存设置也取决于体系大小和计算方法及精度，我的是WIN764位旗舰版，高斯也是WINDOWS版本的，这种版本的最大可以用多少内存，我的机子内存是16G,单机版。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-24 20:28

ztl1978 发表于 2016-9-24 20:07
sob老师您好，我看别人的内存设置达到60G，我想请教一下，是不是只有LINUX版本的高斯才可以设置这么大的内 ...

看Gaussian的位数，和windows还是linux无关。
如果是64bit windows版Gaussian，设多大都行。但是网上没这个版本
如果是32bit windows版Gaussian，一般最多也就1.5GB~1.6GB，目前网上的Gaussian Windows版都是这个版本。

作者
Author: ztl1978 时间: 2016-9-24 20:42
sob老师您的意思是这个版本只能买是吗？网上没有吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-24 22:23

ztl1978 发表于 2016-9-24 20:42
sob老师您的意思是这个版本只能买是吗？网上没有吗？

是
要么你在windows下装个vmware linux虚拟机跑linux 64bit版Gaussian。速度和linux实体系统没什么差别。

作者
Author: ztl1978 时间: 2016-9-25 09:46
哦，谢谢老师

作者
Author: 落花飘雨679 时间: 2016-12-18 21:42
本帖最后由落花飘雨679 于 2016-12-18 21:44 编辑

你好，我在扫描的时候也遇到了同样的问题，请问您是怎样解决的，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-18 22:30

whtu 发表于 2016-7-8 14:16
谢谢sob老师。我生成cosmo文件就是要用于COSMO-RS的计算，照老师这么说，阳离子也就没必要加弥散了。另外 ...

以“描述质量”作为水平的衡量标准时，阴离子加弥散，中性和阳离子不加弥散，这叫做同一级别

作者
Author: Faye 时间: 2017-7-27 16:40
老师，我在做IRC运行时，刚运行就出现了error termination in ntrerr: ntrerr called from fileio的问题，输出文件如下：
Entering Link 1 = C:\G09W\l1.exe PID=    6092.

Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009, Gaussian, Inc.
               All Rights Reserved.

This is part of the Gaussian(R) 09 program.  It is based on
the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.

This software contains proprietary and confidential information,
including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.

This software is provided under written license and may be
used, copied, transmitted, or stored only in accord with that
written license.

The following legend is applicable only to US Government
contracts under FAR:

                  RESTRICTED RIGHTS LEGEND

Use, reproduction and disclosure by the US Government is
subject to restrictions as set forth in subparagraphs (a)
and (c) of the Commercial Computer Software - Restricted
Rights clause in FAR 52.227-19.

Gaussian, Inc.
340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492


---------------------------------------------------------------
Warning -- This program may not be used in any manner that
competes with the business of Gaussian, Inc. or will provide
assistance to any competitor of Gaussian, Inc.  The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
Gaussian, Inc. access to this program.  By using this program,
the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------


Cite this work as:
Gaussian 09, Revision A.02,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian,
A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada,
M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima,
Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr.,
J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers,
K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi,
M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross,
V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann,
O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski,
R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth,
P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels,
O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski,
and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.

******************************************
Gaussian 09:  IA32W-G09RevA.02 11-Jun-2009
            27-Jul-2017
******************************************
%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\RT-IM TS1 OPT FRE IRC.chk
----------------------------------------------------------------------
# irc=calcfc b3lyp/6-31++g(d,p) scrf=check guess=tcheck geom=(connecti
vity,allcheck) genchk
----------------------------------------------------------------------
1/10=4,14=-1,18=20,26=3,29=7,38=1,40=1,44=3,57=2/1,23;
2/9=110,12=2,29=1,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,14=-4,16=1,25=1,30=1,70=2,71=2,74=-5,116=-2/1,2,3;
4/5=101/1;
5/5=2/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
11/6=1,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1,7=6,13=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7/10=1,18=20,25=1/1,2,3,16;
1/10=4,14=-1,18=20,44=3/23(3);
2/9=110,29=1/2;
7/9=1,25=1,44=-1/16;
99//99;
2/9=110,29=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,14=-2,16=1,25=1,30=1,70=5,71=2,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3/1;
5/5=2,38=5/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
11/6=1,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1,7=6,13=1/2;
7/10=1,18=20,25=1/1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,44=3/23(-8);
2/9=110,29=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
7/9=1,25=1,44=-1/16;
99/9=1/99;
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       50 IPos=          2 Q=       13505360

dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 14 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    622080 FType=2 FMxFil=10000

Number          0       501       502       598       989       991       992       993
Base       96256    23552    41472    44032    24576    37888    37376    23040
End       622080    24552    43525    44035    37076    41169    37381    23140
End1       622080    24576    44032    44544    37376    41472    37888    23552
Wr Pntr    96256    23552    41472    44032    24576    37888    37376    23040
Rd Pntr    96256    23552    41472    44032    24576    41169    37381    23140
Length    525824    1000    2053       3    12500    3281       5       100

Number       994       995       996       997       998       999
Base       20480    22528    21504    22016    20992    44544
End       20510    22538    21604    22071    21192    95796
End1       20992    23040    22016    22528    21504    96256
Wr Pntr    20480    22528    21504    22016    20992    44544
Rd Pntr    20510    22538    21604    22069    21192    45796
Length       30       10       100       55       200    51252

dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    1 SizExt =       0 WInBlk =    512
               defal = F LstWrd =    67072 FType=2 FMxFil=10000

Number          0
Base       20480
End       67072
End1       67072
Wr Pntr    20480
Rd Pntr    20480
Length    46592

dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    67072 FType=2 FMxFil=10000

Number          0
Base       20480
End       67072
End1       67072
Wr Pntr    20480
Rd Pntr    20480
Length    46592
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
请问老师，这个问题出在哪里？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-7-28 09:03

Faye 发表于 2017-7-27 16:40
老师，我在做IRC运行时，刚运行就出现了error termination in ntrerr: ntrerr called from fileio的问题， ...

别从chk读信息，或者确保%chk指定的文件确实已经存在。另外路径里不要带空格

作者
Author: anqingpingle 时间: 2018-6-26 21:36
社长大人，我也出现了类似错误。输入：
#P B3LYP/6-311+G** em=GD3 opt freq=raman scrf=SMD  114个原子（两个分子的络合），几何优化了五步之后报错。输出文件的结尾部分： Number          670          672          674          695          698          701
Base       4828704    11699644    11700007    5074418    11701563    11702247
End          4837090    11700007    11700821    5077980    11702247    12171476
End1       4837090    11700007    11700821    5077980    11702247    12171476
Wr Pntr    4828704    11699644    11700007    5074418    11701563    11702247
Rd Pntr    4837090    11699644    11700007    5074418    11701563    11702247
Length          8386          363          814       3562          684       469229

Number          710          711          780          989          993          997
Base       5701697    10500602    5707005    5077980    5090480    5090580
End          5706970    11238802    8111801    5090480    5090580    5092232
End1       5706970    11238802    8111801    5090480    5090580    5092232
Wr Pntr    5701697    10500602    5707005    5077980    5090480    5090580
Rd Pntr    5701697    10500602    8111801    5077980    5090480    5090580
Length          5273       738200    2404796       12500          100       1652

Number          998
Base          20495
End          20695
End1          20695
Wr Pntr       20495
Rd Pntr       20695
Length          200

dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    67072 FType=2 FMxFil=10000

Number             0
Base          20480
End          67072
End1          67072
Wr Pntr       20480
Rd Pntr       20480
Length       46592
Error termination in NtrErr: 我也往前翻了，中间过程没有提示错误。  请社长大人指教！

作者
Author: Chenglong_li 时间: 2018-7-2 17:33
我将软件从D.01换到C.01，就没有再出现如题所述的报错

作者
Author: lucies123 时间: 2018-11-19 21:00
老师，同遇到类似的问题，对有机分子结构进行优化用于动力学，初学都还不太懂

请问下老师我的这个可以怎么解决呢？
out文件：
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /home/gromacs/wyt/scratch/Gau-17488.inp
In source file ml0.f, at line number 195
  ---trace back not available
Error: segmentation violation.
rax.......rbx........
r15......
  ---traceback not available

Log文件:
(...)
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 1 IFilNo(1)=  -526 Len=    212982 IPos=          0 Q= 47864166835528
(...)
Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.

输入文件的开头是:
%nprocshared=16
%mem=30GB
%chk=1_para_H.chk
# opt b3lyp/6-31+g geom=connectivity iop(6/33=2,6/41=10,6/42=17) pop=mk
...

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-20 11:27

lucies123 发表于 2018-11-19 21:00
老师，同遇到类似的问题，对有机分子结构进行优化用于动力学，初学都还不太懂
请问下老师我的这个 ...

别写一堆乱七八糟关键词，基组用得完全不靠谱
怎么算RESP电荷在这里写得极其清楚
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441
先用像样的级别做几何优化，再把fch文件弄到Multiwfn里算RESP电荷

作者
Author: lucies123 时间: 2018-11-29 21:44

sobereva 发表于 2018-11-20 11:27
别写一堆乱七八糟关键词，基组用得完全不靠谱
怎么算RESP电荷在这里写得极其清楚
RESP拟合静电势电荷的 ...

谢谢sob老师，刚开始就是照葫芦画瓢照搬师兄的gjf文件，画得四不像了:( 其实对基组啥的都还不了解，先去补补基础知识

作者
Author: qyyos 时间: 2020-11-19 18:35
我新安装了g09 e.01也遇到了这个问题，提交了只读取了方法基组，不做任何计算就出现错误，log中就是题目中红色标注的：Operation on file out of range.和Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.
segmentation violation。
ssh界面出现的是：
rax 0000000000000000, rbx 0000000000751190, rcx ffffffffffffffff
rdx 0000000000007c4b, rsp 00007ffe7ebc0a88, rbp 00007ffe7ebc0ab0
rsi 000000000000000b, rdi 0000000000007c4b, r8  00002b32bad012c0
r9  0000000000000000, r10 00007ffe7ebc04e0, r11 0000000000000206
r12 00007ffe7ebc2c70, r13 00007ffe7ebc0ce0, r14 00007ffe7ebc0ce8
r15 00007ffe7ebcceb0
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x2b32baeef630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2b32bb434657]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x49c797]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4b47b0]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4abef3]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x40635e]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x403bc1]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x40365c]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4035dd]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2b32bb420555]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4034d9]
感觉大家都出类似的问题，搜来搜去没解决。后来我把文件夹下之前g03计算的.chk文件删掉，同一个gjf再用g09算就可以算了...
这个回帖作为参考吧

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