计算化学公社

标题: orca 5如何方便的冻结原子 [打印本页]

作者
Author: BinWang 时间: 2022-10-18 14:53
标题: orca 5如何方便的冻结原子
各位老师大家好：
我用orca优化一个460原子的体系，头150个原子需要冻结，有什么方便的办法吗？我的版本是 orca_5_0_1

作者
Author: RAL 时间: 2022-10-18 16:03
写个脚本循环输出各个冻结原子的命令

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件，直接就能输入序号设置哪些原子被冻结，极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490（http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html）

任务选择几何优化，然后选-3，直接提示输入被冻结的原子序号

(, 下载次数 Times of downloads: 16)

作者
Author: pikachuupup 时间: 2022-10-18 21:27
比如这样
%geom Constraints
{ C N1 C }
end
end
通过改变输入内容可以达到不同效果
Constraining bond distances : { B N1 N2 value C }
Constraining bond angles : { A N1 N2 N1 value C }
Constraining dihedral angles : { D N1 N2 N3 N4 value C }
Constraining cartesian coordinates : { C N1 C }
摘自5.0.1手册，还有一些其他的用法，你可以自己去看看手册

作者
Author: BinWang 时间: 2022-10-23 15:08

pikachuupup 发表于 2022-10-18 21:27
比如这样
%geom Constraints
{ C N1 C }

非常感谢您

作者
Author: BinWang 时间: 2022-10-23 15:09

sobereva 发表于 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件，直接就能输入序号设置哪些原子被冻结，极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学 ...

非常感谢sob老师，发文章的时候一定引用您的文章和软件

作者
Author: Huyang 时间: 2024-12-26 10:11

sobereva 发表于 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件，直接就能输入序号设置哪些原子被冻结，极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学 ...

sorb老师想问一下，我想冻结134-532,666-2660，我按照这个方法去产生inp文件发现133-531,665-2659冻结了，我是不是在冻结的时候应该都加1去冻结？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-12-26 23:50

Huyang 发表于 2024-12-26 10:11
sorb老师想问一下，我想冻结134-532,666-2660，我按照这个方法去产生inp文件发现133-531,665-2659冻结了 ...

是。Multiwfn里序号始终从1开始计，ORCA从0开始计

作者
Author: GYF12 时间: 2025-12-20 16:07

sobereva 发表于 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件，直接就能输入序号设置哪些原子被冻结，极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学 ...

你好，我下载的Multiwfn_3.8_dev版本，想生成固定原子的orca输入文件，但是没有-3这个选项

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-21 05:20

GYF12 发表于 2025-12-20 16:07
你好，我下载的Multiwfn_3.8_dev版本，想生成固定原子的orca输入文件，但是没有-3这个选项

先把任务类型选成几何优化
认真看Multiwfn下载页面的提示
(, 下载次数 Times of downloads: 0)

作者
Author: GYF12 时间: 2025-12-22 10:57

sobereva 发表于 2025-12-21 05:20
先把任务类型选成几何优化
认真看Multiwfn下载页面的提示

好的，谢谢老师！

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