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标题: 求助：gromacs正在运行中的作业怎么看输出的结构 [打印本页]

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Author: 吧唧爱吃糖 时间: 2022-10-20 23:11
标题: 求助：gromacs正在运行中的作业怎么看输出的结构
正在跑一个比较长的算例，但是想在过程中监测一下构型和速度啥的，但是没找到gro文件，是需要把任务取消掉看完结构在续跑吗？还是gromacs有什么命令可以实现实时看结构那？我尝试了在作业运行过程中直接提取结构文件gmx_mpi trjconv -f .xtc -s .tpr -o，但是报错gmx_mpi: error while loading shared libraries: libhsa-runtime64.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

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Author: sobereva 时间: 2022-10-20 23:45
VMD载入轨迹看最后一帧
或者把最新的cpt转成gro文件

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Author: 大头攒毛 时间: 2022-10-21 09:26
你试试把pr.gro改个名字md.gro，然后就可以用

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Author: 吧唧爱吃糖 时间: 2022-10-21 12:34

sobereva 发表于 2022-10-20 23:45
VMD载入轨迹看最后一帧
或者把最新的cpt转成gro文件

好的老师，明白了

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