计算化学公社

标题: AMD的7系列处理器是否值得购买？GMX应用。 [打印本页]

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Author: jiminfu 时间: 2022-10-23 06:09
标题: AMD的7系列处理器是否值得购买？GMX应用。
现在手中有闲置的3090Ti，想要搭配组一台机器用来主要跑GMX，LAMMPS的MD，可能也会用来跑些CP2K，ORCA小的算例，看sob的装机配置推荐，计算化学购机配置推荐 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)，提到了AMD 5950X这个配置，最近又看到装了7R32配置，想问一下，5950，7950，单路的7R32，前两个高主频（4~5GHz），少核心（16核心），内存容量上限128GB，后面的低主频（3.3GHz），多核心（48核心），大内存容量哪个更适合？GMX的对CPU和GPU间IO需求高吗，上述的两种组合哪个更适用跑GMX？

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-10-23 12:38
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-10-23 12:54 编辑

GPU加速GMX，需要单核性能与多核性能都强的CPU，相同理论多核性能下，单核越强/核数越少越好，因为GPU加速GMX时，CPU部分的计算是纯OpenMP并行，核数过多效率下降明显，甚至产生负效率。3090Ti使用AMD Ryzen 5950X即可，如果要战未来，可用7950X。不推荐EPYC，EPYC只适合计算密集型业务，可以用来跑ORCA、CP2K、LAMMPS。另外，据说LAMMPS使用GPU加速的计算结果（一些统计性质）与CPU计算对不上，慎用LAMMPS GPU加速。

作者
Author: xptracy 时间: 2022-10-23 15:11

Entropy.S.I 发表于 2022-10-23 12:38
GPU加速GMX，需要单核性能与多核性能都强的CPU，相同理论多核性能下，单核越强/核数越少越好，因为GPU加速G ...

4090呢 7950x 还是13代关小核

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-10-23 15:18
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-10-23 15:19 编辑

xptracy 发表于 2022-10-23 15:11
4090呢 7950x 还是13代关小核

不要使用大小核CPU。7950X+4090就行了，目前最佳GMX专用机。前些天我把服务器平台测完了，服务器CPU单核弱，不适合带4090，3090Ti倒是勉勉强强。这几天再测测7950X和13900K，最后会出一篇benchmark网文。

作者
Author: xptracy 时间: 2022-10-23 15:56

Entropy.S.I 发表于 2022-10-23 15:18
不要使用大小核CPU。7950X+4090就行了，目前最佳GMX专用机。前些天我把服务器平台测完了，服务器CPU单核 ...

谢谢，等分享，最近想配2w多，7000系成本比较多，40显卡又没货涨

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-10-23 16:14
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-10-23 16:16 编辑

xptracy 发表于 2022-10-23 15:56
谢谢，等分享，最近想配2w多，7000系成本比较多，40显卡又没货涨

涨不了多久，等就行了，7950X+4090无论如何3万以内肯定能拿下。急用预算又低，5900X+3080Ti吧，最多一万五搞定。

作者
Author: xptracy 时间: 2022-10-23 17:08

Entropy.S.I 发表于 2022-10-23 16:14
涨不了多久，等就行了，7950X+4090无论如何3万以内肯定能拿下。急用预算又低，5900X+3080Ti吧，最多一万 ...

目前价格 7950x X670 DDR5 6000 32G 360水冷 1t+4t 1000W ATX 3.0 差不多1.2w

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Author: Entropy.S.I 时间: 2022-10-23 17:17

xptracy 发表于 2022-10-23 17:08
目前价格 7950x X670 DDR5 6000 32G 360水冷 1t+4t 1000W ATX 3.0 差不多1.2w

HDD应当使用18TB，否则以4090生产轨迹的能力，存储空间1个月就爆满。TB上国行正规渠道带发票的18TB企业级硬盘，1.8k就拿下了

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Author: jiminfu 时间: 2022-10-23 23:00

Entropy.S.I 发表于 2022-10-23 15:18
不要使用大小核CPU。7950X+4090就行了，目前最佳GMX专用机。前些天我把服务器平台测完了，服务器CPU单核 ...

谢谢，期待benchmark文章

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