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标题: 求助gromacs动模拟多金属氧酸盐在乙腈溶剂中的扩散系数的建模 [打印本页]

作者
Author: 果果123 时间: 2022-10-26 20:42
标题: 求助gromacs动模拟多金属氧酸盐在乙腈溶剂中的扩散系数的建模
最近打算模拟多金属氧酸盐在乙腈溶剂中的扩散系数但是在参数设置上不知道如何确定溶剂分子溶质分子以及支持电解质的数目？也不是很确定盒子的大小
实验文章中的细节如下：1 mM V6O7(OCH3)12 with 100mM [NBu4][PF6] in MeCN

以及在未来的研究中如何根据实验中所给浓度的比例确定相关参数的设置？以及盒子的大小与所研究的问题是否相关？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-27 06:39
根据高中化学知识，估计出每个V6O7(OCH3)12需要对应多少[NBu4][PF6]和MeCN，用packmol根据数目比例构建盒子。通常盒子边长至少几个nm。可以5nm左右，一般够大了。

作者
Author: 果果123 时间: 2022-10-27 08:38
好滴感谢sob老师回帖我这就去对应一下

作者
Author: 果果123 时间: 2022-10-27 15:12

sobereva 发表于 2022-10-27 06:39
根据高中化学知识，估计出每个V6O7(OCH3)12需要对应多少[NBu4]和MeCN，用packmol根据数目比例构建盒子。通 ...

sob老师暂时没有找到该溶液的密度是否可以在1L的溶液中将溶剂约等于1L去求他们三个的个数比在等比例缩小从而确定他们的相应个数呢

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-28 06:28

果果123 发表于 2022-10-27 15:12
sob老师暂时没有找到该溶液的密度是否可以在1L的溶液中将溶剂约等于1L去求他们三个的个数比在等比 ...

可以

作者
Author: 果果123 时间: 2022-10-28 15:40

sobereva 发表于 2022-10-28 06:28
可以

好滴感谢sob老师

作者
Author: Kiteliberator 时间: 2024-10-11 11:02

果果123 发表于 2022-10-28 15:40
好滴感谢sob老师

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