计算化学公社

标题: 组氨酸与羟基的质子化问题求助 [打印本页]

作者
Author:
sun877469558    时间: 2022-10-27 21:21
标题: 组氨酸与羟基的质子化问题求助
求助一下各位一个基本问题,一个组氨酸,咪唑环质子化的N原子还能与羟基形成氢键么?如图所示。

作者
Author:
sobereva    时间: 2022-10-28 06:49
可以把咪唑环上多余的基团截掉,然后找个甲醇之类带羟基的简单体系几何优化看看
有可能N上的H与羟基氧形成氢键倾向性更强,导致N和H之间没氢键出现。而且羟基氢和咪唑环另一边的氮有很强的氢键形成倾向。要考虑氢键形成的竞争关系




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