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标题: 求助关于蛋白质和下游蛋白对接的问题 [打印本页]

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Author: Metformin 时间: 2022-10-28 17:00
标题: 求助关于蛋白质和下游蛋白对接的问题
我现在有一个想研究的蛋白，想通过动力学模拟将配体和蛋白质进行200ns的模拟后，通过动力学模拟前后蛋白质和蛋白质互相作用的变化，说明我的配体能够抑制该蛋白，但是在KEGG Pathway网站发现它对下游蛋白的作用是激活其表达。问题是这种情况下是不是应该做蛋白和下游蛋白的启动子DNA二级结构的对接，还是直接做蛋白蛋白互作就可以，如果需要做蛋白质和DNA的互相作用，DNA的二级结构应该怎么获取呢？

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