计算化学公社

标题: 请问一下计算完成后MS里面还能看到真空层大小吗 [打印本页]

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kkxcxx    时间: 2022-10-28 21:58
标题: 请问一下计算完成后MS里面还能看到真空层大小吗
写论文的时候已经记不得当时设置的真空层参数了,有办法找回吗,或者量出来,现在晶胞体积已经是18A左右了,我记得是15或者20Å,有办法确认吗

作者
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牧生    时间: 2022-10-28 22:22
跑nvt,体积不变。跑npt,有真空的话,体积会缩小。一般不常见膨胀。
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乐平    时间: 2022-10-29 09:44
M$ 有你的模型输入文件啊,可以在你的输入文件里看到
作者
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kkxcxx    时间: 2022-10-29 17:08
乐平 发表于 2022-10-29 09:44
M$ 有你的模型输入文件啊,可以在你的输入文件里看到

请问是xsd里面能看到吗?
作者
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乐平    时间: 2022-10-30 09:02
kkxcxx 发表于 2022-10-29 17:08
请问是xsd里面能看到吗?

你找到搭建模型的 .xsd 文件,在空白处点鼠标右键——> Lattice Parameters ,就能看的搭建模型的晶胞参数 a, b, c, 对不对?

用鼠标单击表面的原子,在左侧 Properties 窗口会看到 Fileter Atom 栏,最下方 XYZ 就看看到你选中的原子的直角坐标,对不对?

然后用含有真空层方向的晶胞参数减去表面原子在真空层方向的坐标,就得到真空层的厚度,对不对?

作者
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kkxcxx    时间: 2022-11-3 12:24
乐平 发表于 2022-10-30 09:02
你找到搭建模型的 .xsd 文件,在空白处点鼠标右键——> Lattice Parameters ,就能看的搭建模型的晶胞参 ...

我用测量键长的连接了上下两个周期性对称的同一位置原子,得到了晶胞长度,然后表层和底层各选了一个原子,测量了长度,两个长度相减得到了真空层厚度。因为我发现晶胞不是90*90*90度而是倾斜的,所以坐标不能直接用。感谢你的热心回答!




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