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标题: orca_2mkl转化后的molden文件载入Multiwfn作电子密度差分等值线图,为何显示空白 [打印本页]

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pikachuupup    时间: 2022-10-29 11:39
标题: orca_2mkl转化后的molden文件载入Multiwfn作电子密度差分等值线图,为何显示空白
本帖最后由 pikachuupup 于 2022-10-29 17:32 编辑

各位老师好,我看了http://sobereva.com/113这篇博文后,想仿照“绘制某个体系与组成它的各个片段的密度差图实例”利用orca进行练习,我按照博文在B97-3c下分别对丙酮和水的复合物、丙酮、水进行了单点计算,且保证笛卡尔坐标的一致,然后将输出的gbw文件利用orca_2mkl转化为了molden文件,可是将其载入Multiwfn作电子密度差分等值线图时,图片显示为空白,这是为什么呢?附上我的三个输入文件,谢谢各位老师。
! B97-3c tightSCF
%maxcore  2000
%pal nprocs   16 end
* xyz   0   1
  C   -4.50931809990539      0.69982286812366      3.69848884914846
  H   -4.69155727529197      0.65043384629136      4.76660513467270
  H   -3.62837845920718      1.31700616458535      3.51361702151242
  H   -5.34316507354925      1.19169142043174      3.19768727235686
  C   -4.28075830827235     -0.67594604714367      3.13643976845139
  C   -4.22914905276305     -0.79761764947856      1.63963121594571
  H   -3.82149967881823     -1.75765175595753      1.34152093773873
  H   -5.24456800677477     -0.71422319042756      1.24660963654372
  H   -3.65614329219510      0.01642026794799      1.19733080315461
  O   -4.15211947497505     -1.64136990521310      3.87275073635148
  O   -3.73873318690027     -4.09349675227982      2.39332750013443
  H   -3.05555586980057     -4.63281144043504      2.80258085122209
  H   -3.87831561154655     -3.36495527644478      3.02353424276724
*
! B97-3c tightSCF
%maxcore  2000
%pal nprocs   16 end
* xyz   0   1
  C   -4.50931809990539      0.69982286812366      3.69848884914846
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  H   -3.62837845920718      1.31700616458535      3.51361702151242
  H   -5.34316507354925      1.19169142043174      3.19768727235686
  C   -4.28075830827235     -0.67594604714367      3.13643976845139
  C   -4.22914905276305     -0.79761764947856      1.63963121594571
  H   -3.82149967881823     -1.75765175595753      1.34152093773873
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  H   -3.65614329219510      0.01642026794799      1.19733080315461
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*
! B97-3c tightSCF
%maxcore  2000
%pal nprocs   16 end
* xyz   0   1
  O   -3.73873318690027     -4.09349675227982      2.39332750013443
  H   -3.05555586980057     -4.63281144043504      2.80258085122209
  H   -3.87831561154655     -3.36495527644478      3.02353424276724 *

下面是我在Multiwfn里依次的输入,谢谢老师
C:\Users\lenovo\Desktop\12\12.molden.input
4
0
2
-,C:\Users\lenovo\Desktop\1\1.molden.input
-,C:\Users\lenovo\Desktop\2\2.molden.input
1
2
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作者
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sobereva    时间: 2022-10-29 16:52
molden文件压缩后上传,超过5MB就传网盘,输入的所有命令贴出来
作者
Author:
pikachuupup    时间: 2022-10-29 17:31
sobereva 发表于 2022-10-29 16:52
molden文件压缩后上传,超过5MB就传网盘,输入的所有命令贴出来

谢谢老师,我重新编辑了贴子,把文件和命令贴出来了
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Author:
sobereva    时间: 2022-10-30 04:00
作图平面选取不当,主功能0里对照坐标轴就能知道,你绘制的Z=0的XY平面都没穿过分子,如下图粉线所示
(, 下载次数 Times of downloads: 32)

注意看下文4.2节了解怎么恰当选择作图平面
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452



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Author:
pikachuupup    时间: 2022-10-30 09:39
sobereva 发表于 2022-10-30 04:00
作图平面选取不当,主功能0里对照坐标轴就能知道,你绘制的Z=0的XY平面都没穿过分子,如下图粉线所示

我明白了,谢谢sob老师~




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