计算化学公社

标题: 如果预算20万左右，请教一下如何配置服务器 [打印本页]

作者
Author: landian666 时间: 2022-10-31 13:31
标题: 如果预算20万左右，请教一下如何配置服务器
主要用途包括分子动力学计算（GROMACS等）以及量子化学计算（高斯等），谢谢！

作者
Author: 牧生 时间: 2022-10-31 13:49
一台还是多台？几个人用？

作者
Author: landian666 时间: 2022-10-31 13:57
本帖最后由 landian666 于 2022-11-16 09:05 编辑

牧生发表于 2022-10-31 13:49
一台还是多台？几个人用？

配置服务器集群，多人使用。

作者
Author: Eudaimonia 时间: 2022-10-31 14:17

landian666 发表于 2022-10-31 13:57
一台，经常性的是一个人用。

那基本就照着sob老师给的最顶级的推荐买再加一块4090吧，还有钱还非得花可以考虑内存再翻倍

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-31 15:17
跑gmx的，13900K搭配RTX4090

跑Gaussian（或其它靠CPU的任务），按下文配
淘宝上购买的双路EPYC 7R32 96核服务器的使用感受和杂谈
http://sobereva.com/653（http://bbs.keinsci.com/thread-32755-1-1.html）

根据两类任务的实际比重，决定以上配置各买几台。

作者
Author: landian666 时间: 2022-10-31 16:09

sobereva 发表于 2022-10-31 15:17
跑gmx的，13900K搭配RTX4090

跑Gaussian（或其它靠CPU的任务），按下文配

谢谢各位的回复，有一个问题想请教sob老师，看了您http://sobereva.com/444中的推荐，结合本帖“各买几台”建议，我的理解是：在达到”顶级双路服务器推荐配置“后，再增加CPU核数或者GPU数量，都不能进一步提高服务器的算力了吗？比如我将”顶级双路服务器推荐配置“中的CPU和GPU都翻倍，能否翻倍提升顶级配置的算力？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-31 16:38

landian666 发表于 2022-10-31 16:09
谢谢各位的回复，有一个问题想请教sob老师，看了您http://sobereva.com/444中的推荐，结合本帖“各买几台 ...

不要以为一台机子里的CPU是任你无限扩充的

作者
Author: landian666 时间: 2022-10-31 17:06

sobereva 发表于 2022-10-31 16:38
不要以为一台机子里的CPU是任你无限扩充的

我在某东上一个大牌看了一个配置的报价，如附件，看帖子是sob老师非常不推荐的途径，想请教sob老师，这个配置与“顶级双路服务器推荐配置”相比，算力的区别大吗？是不是性价比比较低？

作者
Author: funyboy 时间: 2022-10-31 17:34

landian666 发表于 2022-10-31 17:06
我在某东上一个大牌看了一个配置的报价，如附件，看帖子是sob老师非常不推荐的途径，想请教sob老师，这个 ...

一台可以买好几台，不要当冤大头。

作者
Author: 刘恪立 时间: 2022-10-31 17:46

landian666 发表于 2022-10-31 17:06
我在某东上一个大牌看了一个配置的报价，如附件，看帖子是sob老师非常不推荐的途径，想请教sob老师，这个 ...

戴尔机器太贵了，不合适的~

作者
Author: gog 时间: 2022-10-31 20:19
不是做AIMD，不需要A100计算加速卡。普通显卡运行gmx、lammps，就很牛逼。

作者
Author: abin 时间: 2022-10-31 20:35
老生常谈
这20万，是你全权支配，
还是按照规章制度，
招标采购？

如果是你自费，当我没说。

超过10万元的科研经费采购，
可以不招标？

作者
Author: sun35mr 时间: 2022-11-1 01:00
20万的话还是老实走个能开正规发票的吧，现在好像政府采购已经不是必须的了

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-1 04:53

landian666 发表于 2022-10-31 17:06
我在某东上一个大牌看了一个配置的报价，如附件，看帖子是sob老师非常不推荐的途径，想请教sob老师，这个 ...

跑动力学用A100完全没意义。远不如用RTX4090

作者
Author: 令狐 时间: 2022-11-1 11:27

abin 发表于 2022-10-31 20:35
老生常谈
这20万，是你全权支配，
还是按照规章制度，

对，这个很重要，如果是招标走代理的话，起码的20%的费用就没了，代理商肯定的抽成，你的照着16万左右的费用去话~

作者
Author: landian666 时间: 2022-11-1 11:39
本帖最后由 landian666 于 2022-11-1 21:49 编辑

sobereva 发表于 2022-11-1 04:53
跑动力学用A100完全没意义。远不如用RTX4090

有两个问题想再请教sob老师：
1、“远不如用RTX4090”的意思是性能效率远不如吗？还是指的性能效率差不多，就是价钱太贵，性价比不高？（我看这个网页的测评RTX4090显卡AI性能测试及与其他显卡性能对比 - 知乎 (zhihu.com)，感觉RTX4090和A100对于动力学来说效率性能差不多）
2、如果考虑以后有可能做的任务扩展的话，比如AIMD、深度学习等任务，有必要直接上A100吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-2 07:42

landian666 发表于 2022-11-1 11:39
有两个问题想再请教sob老师：
1、“远不如用RTX4090”的意思是性能效率远不如吗？还是指的性能效率差不 ...

1 跑gmx的速度明显不如RTX4090，架构差了一代。2020年的A100单精度浮点性能19.5 T，RTX4090是82.6 T。AI性能测试跟跑gmx的情况是两码事，深度学习性能关键是大规模矩阵乘，是主要靠tensor core负责的。再加上A100几倍于RTX4090的价格，更没任何理由考虑了。

2 AIMD看具体什么程序

作者
Author: landian666 时间: 2022-11-2 10:31

sobereva 发表于 2022-11-2 07:42
1 跑gmx的速度明显不如RTX4090，架构差了一代。2020年的A100单精度浮点性能19.5 T，RTX4090是82.6 T。AI ...

谢谢sob老师回答。
还有两个问题请教：
1、有必要配大于两张的RTX4090吗？
2、同一台服务器的RTX4090能实现并行跑MD吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-3 08:39

landian666 发表于 2022-11-2 10:31
谢谢sob老师回答。
还有两个问题请教：
1、有必要配大于两张的RTX4090吗？

如果经常同时跑两个任务可以配俩4090
4090不支持NVlink，两个一起跑同一个任务很不理想

作者
Author: 令狐 时间: 2022-11-3 09:28
这个预算很充足哈，纯计算不需要上显卡，配3台顶配全新的AMD双路128核心的设备都可以了，有钱真好~

作者
Author: landian666 时间: 2022-11-16 08:45

sobereva 发表于 2022-11-3 08:39
如果经常同时跑两个任务可以配俩4090
4090不支持NVlink，两个一起跑同一个任务很不理想

老师，您好，想请教几个问题，最近很多新一代CPU、GPU要上市，性能都有很大的提高，比如英特尔第四代至强处理器 Sapphire Rapids等，如果现在配服务器的话，有必要等这些新款上市后再配吗？如果等的话一般需要多久能我们才能买到？还是说按您之前帖子里推荐的 8375C+RTX4090就可以？计算化学购机配置推荐 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)

作者
Author: landian666 时间: 2022-11-16 12:41

sobereva 发表于 2022-11-3 08:39
如果经常同时跑两个任务可以配俩4090
4090不支持NVlink，两个一起跑同一个任务很不理想

现在是计划配置集群~

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-16 20:31

landian666 发表于 2022-11-16 08:45
老师，您好，想请教几个问题，最近很多新一代CPU、GPU要上市，性能都有很大的提高，比如英特尔第四代至强 ...

一分钱一分货，新产品中的顶级型号性能无疑比现在顶级的性能更好，但价格也贵得多，不会带来更高的性价比。倘若你不差钱而且愿意等、追求极限性能，等也罢。如果手头有研究要做，或者预算不是无限的，赶紧买机子就完了，早买早用。

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