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标题: 关于gentor旋转生成构象问题 [打印本页]

作者
Author: GHL 时间: 2022-10-31 16:15
标题: 关于gentor旋转生成构象问题
之前采用的Confab生成的构象不满足计算结果

采用gentor生成构象，一共有近6个旋转键，按照文献每十度旋转（自己这边的化学知识不是太好，农学的），一共生成的构象候选物都接近百万级别了，不知道哪位大佬能指点一下，如何合理设置gentor参数或怎样旋转合理一些？分子的结构和相关文献的图附上
谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-31 16:36
显然没必要每10度转一次，诸如1'-2一次转180度，共两次就够了
仔细看我帖子里的例子是怎么考虑的
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html

作者
Author: GHL 时间: 2022-10-31 19:36

sobereva 发表于 2022-10-31 16:36
显然没必要每10度转一次，诸如1'-2一次转180度，共两次就够了
仔细看我帖子里的例子是怎么考虑的
gentor ...

好的，谢谢大佬指点，谢谢

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